Bio Technical フォーラム

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SiRNA設計時のホモロジーサーチについて トピック削除
No.1350-TOPIC - 2009/10/14 (水) 23:14:12 - K
SiRNA初心者です。Web上でSiRNAの設計を行っていますが、off-Targetを引き起こす可能性の高いsiRNA候補配列を除く場合、何を参考にされていますか？今まで見た中ではNCBIのBLASTが多いようですが、、他にもあれば教えてください。

また、設計したSiRNAの合成を依頼する場合、どこのメーカーが良いとかありますか？

本当に基本的なことですみません。よろしくお願いします。
　
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(無題) 削除/引用
No.1350-2 - 2009/10/15 (木) 15:29:27 - MP
今もあるかどうかわかりませんがsiDirectというサイトがよかったです。
ただ近年はvalidateされたsiRNAが売られているので、わざわざ自分で設計する必要はないのでは？

SiRNA設計時のホモロジーサーチについて 削除/引用
No.1350-1 - 2009/10/14 (水) 23:14:12 - K
SiRNA初心者です。Web上でSiRNAの設計を行っていますが、off-Targetを引き起こす可能性の高いsiRNA候補配列を除く場合、何を参考にされていますか？今まで見た中ではNCBIのBLASTが多いようですが、、他にもあれば教えてください。

また、設計したSiRNAの合成を依頼する場合、どこのメーカーが良いとかありますか？

本当に基本的なことですみません。よろしくお願いします。
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