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FermentasのFastDigest制限酵素 トピック削除
No.1345-TOPIC - 2009/10/14 (水) 16:41:50 - in situ
いつもお世話になります。

DNAの切断に使う制限酵素ですが、今までNEB、TAKARA、TOYOBOの中で安いものを使ってきたのですが、最近FermentasのFastDigestというものが気になっています。

バッファーが共通ですし、5分で切れるという謳い文句が本当ならかなり魅力的です。

最近輸入代理店であるコスモバイオの価格が改訂されて、NEBなどの価格にかなり近づいてきているので、ごっそりと移行することも考えています。

ただ、5分で本当に切れるのか、star活性、endonuclease活性などは大丈夫なのか、などが気になります。

FermentasのFastDigestを使った経験がある、常用されている、という方いらっしゃいましたら、感想などいただけるとうれしいです。

よろしくお願いします。
 
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No.1345-8 - 2009/10/16 (金) 20:27:30 - +
あ、ちなみに酵素がNEBでも切れます。

(無題) 削除/引用
No.1345-7 - 2009/10/16 (金) 20:26:26 - +
パンタさんのように詳しく実験はしていませんが、バッファーはFermentasのもので、TOYOBOの酵素を混ぜてもスター活性も起こらず5分で切れました。バッファーだけ欲しかったので問い合わせましたが、それのみは売ってないということなので、私はバッファーに何か秘密があるのではと考えています。詳細は不明ですが・・・

(無題) 削除/引用
No.1345-6 - 2009/10/16 (金) 12:04:32 - in situ
パンタさま

コメント大変ありがとうございます。
比較検討結果大変参考になりました。

やはり、酵素の方に秘密があるのですね。

現在まだ研究室に制限酵素があまりそろっていない状態なので、とりあえずいくつかFastDigestシリーズを買ってみようと思います。

試した結果をまた報告します。

ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.1345-5 - 2009/10/16 (金) 11:31:05 - パンタ
あ、下のやつの結論、「秘密は酵素にあり」と私は考えています。

(無題) 削除/引用
No.1345-4 - 2009/10/16 (金) 11:28:28 - パンタ
同じことが気になって、サンプルをもらい実験してみました。
SacIでpUC19を切断しました。反応はサーマルサイクラーで行いました。

Fermentasの酵素、バッファーを使うと、ちゃんと5分で切れました。約500ng切断しましたが、ほぼ完全切断でした(環状は電気泳動で見えないレベル)。

TakaraのSacI(20units、多め)+Fermentasのバッファーでは、5分では5~7割程度しか切れませんでした。

TakaraのSacI(20units)+Takaraのバッファーでも5分では5~7割程度しか切れませんでした。

Fermentasの酵素+Takaraのバッファーでも切ってみたところ、ほぼ完全切断されました。

自前のSacIサイトのないプラスミドを用いて、1時間反応させてみましたが、star活性、endonuclease活性は見られませんでした。

他の酵素では試していませんが、謳い文句通りの酵素であると考えています。
現在もサンプルをもらえるのであれば、ぜひ1度ご検討ください、、、って、なんか営業みたいになってしまいましたね

(無題) 削除/引用
No.1345-3 - 2009/10/16 (金) 11:08:54 - in situ
+さま

コメントありがとうございます。

FermentasのFastDigestシリーズは酵素の方を反応速度が速いやつをスクリーニングしてきたのだと思っていたのですが、バッファーの方がみそなのでしょうか?

従来の制限酵素(NEBとかTAKARAとか)でも、FastDigestのバッファーを使えば早く切れるのですか?

(無題) 削除/引用
No.1345-2 - 2009/10/15 (木) 21:40:59 - +
こんばんは。

Fermentas、酵素というか、バッファーを重宝していました。一度限界にチャレンジしてみましたが、切れる量を気にしなければ1分でも切れます(笑)

FermentasのFastDigest制限酵素 削除/引用
No.1345-1 - 2009/10/14 (水) 16:41:50 - in situ
いつもお世話になります。

DNAの切断に使う制限酵素ですが、今までNEB、TAKARA、TOYOBOの中で安いものを使ってきたのですが、最近FermentasのFastDigestというものが気になっています。

バッファーが共通ですし、5分で切れるという謳い文句が本当ならかなり魅力的です。

最近輸入代理店であるコスモバイオの価格が改訂されて、NEBなどの価格にかなり近づいてきているので、ごっそりと移行することも考えています。

ただ、5分で本当に切れるのか、star活性、endonuclease活性などは大丈夫なのか、などが気になります。

FermentasのFastDigestを使った経験がある、常用されている、という方いらっしゃいましたら、感想などいただけるとうれしいです。

よろしくお願いします。

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