Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

DNA解析ソフト トピック削除
No.130-TOPIC - 2009/03/04 (水) 10:39:43 - DNA
遺伝子とタンパク質配列解析全般ができるソフトをラボで購入するため調べています。
Lasergene package, Vector NTI, CLCなどが有名かと思いますが、その他のソフトも含め、シェア率と言いますか、どれが広く使われているのでしょうか?
シーケンサーのデータ解析、遺伝子やプラスミド配列と解析、PCR、タンパク質二次構造、ホモロジー解析、、、、などなど標準的なことは一通りできるパッケージで探しています。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



8件 ( 1 〜 8 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.130-8 - 2009/03/06 (金) 00:06:53 - A
既に出ていますが私もBioEditに一票です。

買うにしろお試しで 削除/引用
No.130-7 - 2009/03/05 (木) 21:43:38 - ema
好みによりますがGENETYXよりかlasergeneが好きという先生はうちにはいます。
購入タイプのソフトも30day使用版というものはたいていのメーカー出してますから、もらってはいかがですか?
すごく急いでないなら、中くらいの人と初心者の人を選出して、がんばってテスト要員としてさわらせて決めた方が良いと思います。
複数のライセンスって研究室の人全員分買う訳じゃないですよね。
共通パソコンにいれて時間予約制とかにして調整していけばそんなに高くないと思うんですが。

(無題) 削除/引用
No.130-6 - 2009/03/05 (木) 12:08:17 - DNA
ラボみんなで使うソフトを探してくれないかと言われています。
DNA上級、中級、初心者の人が混ざっていて、フリーのソフトを組み合わせて使うと、スキルが高くない人には厳しいため、一通りのことが何でも出来るパッケージで、と考えています。
複数のライセンスを買うことになるので予算も結構大きくて、ちょっとビビっているんです。。。

隣のラボがLasergeneなこと、以前Lasergeneを使ったことがある人(私も)が多いことから、Lasergeneに使用かと思っているんですが。。。
(Lasergeneでいいと思います????)

(無題) 削除/引用
No.130-5 - 2009/03/05 (木) 11:26:01 - EcoRI
この手のソフトは、人によって、使いやすい使いにくいがあると思います。
とりあえず、フリーソフトを使ってみてはいかがでしょう?
Win環境ならBioEdit
Macの場合、決め手に欠けるのですが、CLCとかGeneiousとか
あとは、特化ソフトをそろえる(4PEAKS, EnzymeX, ApE, Sequnece Analysisとか)

(無題) 削除/引用
No.130-4 - 2009/03/05 (木) 10:32:57 - よっしー
とりあえずVector NTIやBio editを使ってみて,
合わなければ他のものを試してみてはどうですか?
何っていったってタダですから.

うちでは 削除/引用
No.130-3 - 2009/03/05 (木) 10:29:25 - ema
GENETYXの古いのとVectorの古いのとlasergeneの最新版8.0を持っています。
laserは将来的には次世代のデータものせれるように変更が有るってきいて、そう複数持つものでもないので決めました。

わたしの周辺では・・・ 削除/引用
No.130-2 - 2009/03/04 (水) 20:39:51 - tokyo
「GENETYX」とABIの「Variant Reporter」(VR)が多いようです。
VRは作図なども楽チンですよ。
・・・・高いけど。

DNA解析ソフト 削除/引用
No.130-1 - 2009/03/04 (水) 10:39:43 - DNA
遺伝子とタンパク質配列解析全般ができるソフトをラボで購入するため調べています。
Lasergene package, Vector NTI, CLCなどが有名かと思いますが、その他のソフトも含め、シェア率と言いますか、どれが広く使われているのでしょうか?
シーケンサーのデータ解析、遺伝子やプラスミド配列と解析、PCR、タンパク質二次構造、ホモロジー解析、、、、などなど標準的なことは一通りできるパッケージで探しています。

8件 ( 1 〜 8 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を