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ノックアウト後のトランスクリプト トピック削除
No.126-TOPIC - 2009/03/03 (火) 10:30:29 - KO
初歩的なことで恐れ入ります。

エクソン2だけをなくすノックアウトアリルの場合、ノックアウト後のトランスクリプトは、

エクソン1だけ。
エクソン1−3−4−5とスキップして続く。
エクソン1にイントロン1がくっついたまま。
予想は出来ない。。。

のどれになるのでしょうか?KOMPを取り寄せようかと思っているのですが教えてもらえたら幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.126-3 - 2009/03/04 (水) 10:32:11 - KO
FRTではさまれたneoが入っています。
スプライシングバリアントはなく3の倍数でもないので、neoを外した後もKOは大丈夫のようでした。
ESを取り寄せて、マイクロインジェクション以降を所属機関でやろうと思っています。

(無題) 削除/引用
No.126-2 - 2009/03/03 (火) 12:57:12 - ドクタースランプ
予想はできないと思いますが・・・

イントロンに neo は残したままなのでしょうか?
neo を外してあって(lox だけなどになっていて)、さらに exon 2 が抜けた splicing variant が報告されているようでしたら、1−3−4−5と続く可能性が考えられると思います。

ついでに、exon 2 が3の倍数でなければ frame がずれるので、ほぼKOされていると考えて良いと思います。

KOMP から ES を取り寄せるのでしょうか?

ノックアウト後のトランスクリプト 削除/引用
No.126-1 - 2009/03/03 (火) 10:30:29 - KO
初歩的なことで恐れ入ります。

エクソン2だけをなくすノックアウトアリルの場合、ノックアウト後のトランスクリプトは、

エクソン1だけ。
エクソン1−3−4−5とスキップして続く。
エクソン1にイントロン1がくっついたまま。
予想は出来ない。。。

のどれになるのでしょうか?KOMPを取り寄せようかと思っているのですが教えてもらえたら幸いです。

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