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(無題) 削除/引用 No.1244-7 - 2009/09/25 (金) 16:37:48 - BlueHornet dNTPに一票。 分注前のPCRミクスチャーの吸光度をはかってみてください。 しっかりと260nmに吸収があるはずですよ。

(無題) 削除/引用 No.1244-6 - 2009/09/25 (金) 16:37:08 - in situ PCR産物のDNAだけではなく、プライマーやdNTPといったヌクレオチドおよびオリゴ260nmの吸光度のピークを持ちます。 PCRをかける前の溶液の吸光度を測ってみれば、同じくらいの値がでるはずです。 したがって、PCR溶液の吸光度を測ってPCRがうまくいったかどうかをテストするのは無意味です。

PCR・バンドが無いのに、260nmにピークがある。 削除/引用 No.1244-5 - 2009/09/25 (金) 16:25:25 - こひなた in situ　様 お察しの通り、学生です。 ネガコンは a. 元のサンプルです。 ここではテンプレートを入れていない、PCR溶液 を指しております。 このネガコンの260 nmのピークが、ポジコンと同程度出てしまい、 悩んでいるところです。

(無題) 削除/引用 No.1244-4 - 2009/09/25 (金) 16:23:09 - 暑い！ 電気分解→電気泳動ですよね？ それはさておき、dNTPに一票！

(無題) 削除/引用 No.1244-3 - 2009/09/25 (金) 16:19:18 - in situ 学生さんかとお見受けしますが、用語の使い方、状況説明の仕方が不適切です。 1. ×電気分解 ○電気泳動 2. >ネガコンの吸光度を測ったところ これは、何の吸光度でしょうか？ a. 元のサンプル b. ゲルそのもの c. ゲルからバンドがあると思われる場所を切り出してそれを抽出したもの たぶんa.だと思うのですが、その場合、元のサンプルはどのようなものでしょうか？ DNA以外にも260nmにピークをもつものはありますし、PCR溶液とかだったらdNTPなんかが入っているので260nmにピークは必ず出ます。

(無題) 削除/引用 No.1244-2 - 2009/09/25 (金) 16:16:39 - 通りすがり プライマーとか。。。

PCR・バンドが無いのに、260nmにピークがある。 削除/引用 No.1244-1 - 2009/09/25 (金) 16:09:27 - こひなた PCR産物をアガロースゲルで電気分解したところ、ネガコンでバンドが出ませんでした。 ところが、そのネガコンの吸光度を測ったところ260 nmにピークが出たのです。 DNA 以外のコンタミでしょうか？ また、このコンタミの正体は何でしょうか？ お分かりの方、同様の経験をされた方、教えて下さい。

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