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Cre/LoxP トピック削除
No.1238-TOPIC - 2009/09/24 (木) 13:54:18 - ちびた
BACベクターのHomologousなLoxPサイトに相同組換えで
インサートを入れようとしているのですが、
Kn、Cm二重耐性で取れてくるクローンのDNAサイズが
何故か期待したものより小さくなってしまってしまいます。
このような経験をされた方はいらっしゃいますか?
セレクション濃度はCm 10micro g/mLおよびKn 50micro g/mLで、
ベクターは100kb、インサートは10kbほどです。
セレクションしている間にDNAがちびてしまったのでしょうか・・・。
 
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ありがとうございます! 削除/引用
No.1238-3 - 2009/09/24 (木) 14:55:55 - ちびた
早速のご回答ありがとうございます。
BACがそんなにすぐちびるものだとは知りませんでした。
逆に、Cm 10micro g/mLおよびKn 50micro g/mLでも
増えまくるのは怪しいのでしょうか。
Cmはこれ以上濃度を下げなくて大丈夫ですか?

(無題) 削除/引用
No.1238-2 - 2009/09/24 (木) 14:40:58 - ats
BACは培養中にdeletionしやすいので、元のBACクローンは問題ないでしょうか。
問題がある場合、もう一度クローニングして正常サイズのBACを持ってるクローンを拾ってください。20-25度で培養するとdeletionしにくい時もあります。
また、Kn濃度は20-25ug/mL(親株が生えてこないぎりぎりの濃度)まで下げてもよいかも。

Cre/LoxP 削除/引用
No.1238-1 - 2009/09/24 (木) 13:54:18 - ちびた
BACベクターのHomologousなLoxPサイトに相同組換えで
インサートを入れようとしているのですが、
Kn、Cm二重耐性で取れてくるクローンのDNAサイズが
何故か期待したものより小さくなってしまってしまいます。
このような経験をされた方はいらっしゃいますか?
セレクション濃度はCm 10micro g/mLおよびKn 50micro g/mLで、
ベクターは100kb、インサートは10kbほどです。
セレクションしている間にDNAがちびてしまったのでしょうか・・・。

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