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(無題) 削除/引用 No.1096-5 - 2009/08/25 (火) 17:31:59 - Pumpkin 下記サイトに詳細表示あります。ご参考までに。こういったものは注釈がかならずどこかにあるわけで、頑張って探しましょう。 これでトピ主さんの疑問も解決するはずだと思います。 //www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/key.html#accessions

(無題) 削除/引用 No.1096-4 - 2009/08/25 (火) 13:15:30 - PubMed Pumpkinさん、ご回答ありがとうございます。 partial CDSと表記される場合もあるのですね、知りませんでした。complete CDSと書かれているのは「完全長」のmRNAであるということを示しているのですね。その点で少し疑問なのですが、教えていただけますでしょうか？ 昨日から色々調べてみたのですが、同じ遺伝子でもNCBIに複数のナンバーで登録されてたりしますよね。私が注目している遺伝子もそうなのですが、一つは（NM_〜〜〜というナンバー）約1700bpくらいで登録されていて、「complete CDS」という表記はなし（「partial CDS」という表記もなし。）。もう一つは（AF〜〜〜というナンバー）約1500bpくらいで登録されていて「complete CDS」という表記がされています。 登録塩基数が短い方に「complete CDS」と書かれていて、長い方に「complete CDS」とは書かれていない…どうしてなのか分からず混乱してきました…。 どういうことが考えられるのか教えていただけると助かります。

(無題) 削除/引用 No.1096-3 - 2009/08/25 (火) 07:12:47 - Pumpkin 質問の意図に合っていれば、「完全長」か「完全長でない」かの違いであるように思いますが、complete CDSとpartial CDSの違いということですか？

(無題) 削除/引用 No.1096-2 - 2009/08/24 (月) 22:09:52 - PubMed すいません、投稿内容の変更です。少し勘違いで書いている部分がありました。 complete CDSと書かれているのは2段目の「DEFINITION」というところでした。linearは「Locus」のところの記載でして、勘違いでした。 改めての質問なのですが、遺伝子によってcomplete CDSと書かれているものもあれば、書かれていないものもあるのですが、どういった違いを現しているのでしょうか？ 自分で質問しておきながら、質問内容を間違える。反省しています。見にくい投稿ですいません。

NCBIのnucleotide検索の見方について 削除/引用 No.1096-1 - 2009/08/24 (月) 21:58:17 - PubMed いつも勉強させていただいています。 PubMedの使い方で教えていただきたいのですが、NCBIのnucleotide検索でそれぞれの遺伝子の配列などを調べていると、一番上の段の「locus」というところに、「NM_〜〜〜、〜bp、mRNA linear」と書かれていたりします。このlinearの部分がcomplete CDSになっている遺伝子もあります。この2種類の表記の違いはどういう意味なのか教えていただけると助かります。 まだ研究を始めたばかりの初心者で基本的な質問で申し訳ないのですが、よろしくお願いします。

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