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(無題) 削除/引用 No.1066-3 - 2009/08/18 (火) 17:48:13 - もも wrさん 回答ありがとうございます。 すごく一般的な話になってしまい申し訳ないのですが、逆側のストランド（アンチセンス鎖と呼ぶようにします）に結合した転写因子はセンサ鎖の3’側下流にある遺伝子の発現を制御したりするのでしょうか？今回調べたい目的遺伝子は転写因子結合部位よりセンサ鎖の3’側下流に存在しています。 この質問は、転写因子が自分の結合しているストランドの3’側下流にある遺伝子だけを制御するのか、それとも向かい側のストランドの5’上流側にある遺伝子発現も制御できるのかということで、転写因子によっても違うこともあるでしょうし、あいまいすぎてお答えにくいかと思いますが、何か知っていることや、経験したことがあれば教えていただけますでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.1066-2 - 2009/08/18 (火) 16:58:23 - wr 逆側のストランドっす。

TFSEARCHでの転写因子解析について 削除/引用 No.1066-1 - 2009/08/18 (火) 16:22:37 - もも いつも勉強させていただいております。 TFSEARCHという転写因子解析データベースにて興味のあるプロモーター領域に集まる転写因子を調べてみているのですが、その際、ヒットした転写因子が結合するであろうDNA領域に矢印がつきます。 この矢印についてなのですが、「→」の場合と「←」の場合と2通りでてきます。自分で書き込んだプロモーター配列は左から右へ上流から下流向きにしておりますので、「→」の場合は分かるのですが、「←」の場合は下流（右側）にある遺伝子の発現を制御する訳ではないのでしょうか？逆側のストランド（相補鎖）に結合するということを示しているのでしょうか？どういうことなのでしょう？ 理解していただけたでしょうか？分かりにくい日本語になってしまい申し訳ありません。このデータベースで調べた経験のある方はおられるでしょうか？ よろしくお願いします。

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