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(無題) 削除/引用 No.1018-4 - 2009/08/10 (月) 09:12:42 - ~ その生物についてどこまで情報があるのかによって、やり方が変わってくると思いますが。 増やそうとしている遺伝子のオルソログの配列でblastをかけたらその材料のゲノム配列が引っかかりませんか？ そこから、ヒットしない方のプライマーとアニールしそうな配列が見つかりませんか？ 増えているのであれば、ダイレクトシークエンシングをしてしまってもいいのでは？

(無題) 削除/引用 No.1018-3 - 2009/08/10 (月) 02:51:38 - おお >[Re:1] saya1982さんは書きました : > ゲノムDNAを用いてPCRを行ってます． > 元の配列を検索する場合は > complete cds > mRNA > clone〜 > 何れをみるのが妥当なんでしょうか？ ゲノムDNAを増幅したいわけでしたら、参照するデータあるいはデーターベースは ゲノムDNAを見るのが普通です。 cDNA、mRNAやCDSはゲノムの情報が部分的に抜けている場合が結構あります。 参照している論文には何かインフォメーションはないのでしょうか?

(無題) 削除/引用 No.1018-2 - 2009/08/09 (日) 19:57:28 - ami っ http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?command=start プライマーからプロダクトサイズ計算

PCRのバンドの高さ 削除/引用 No.1018-1 - 2009/08/09 (日) 19:30:07 - saya1982 最近，実験をはじめた初心者であります． みなさんに教えて頂きたいのですが， 現在，ある遺伝子のシークエンスを調べております． 過去の論文(始めて発見された時の論文)を参考にして， その通りにプライマーを用いてPCRを行いました． 電気泳動してでてきたバンドが正しいかどうかを 検討してます． 今までは，各プライマーをblastで検索して 元の塩基配列よりバンドの高さを検討してました． 今回，どうしても片方のプライマーがひっかかりません． そのような場合， みなさんはどのようにして行っているのでしょうか？ もう一つの質問があります． ゲノムDNAを用いてPCRを行ってます． 元の配列を検索する場合は complete cds mRNA clone〜 何れをみるのが妥当なんでしょうか？ 場違いの質問かもしれませんが，御容赦ください． 前任者が退職して質問する相手がいない状態で 困っております．

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