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フェノクロ抽出やダイレクトPCR溶液で細菌のDNA抽出は可能か トピック削除
No.9997-TOPIC - 2021/10/25 (月) 22:13:18 - スーも
フェノクロ抽出やダイレクトPCR溶液で細菌のDNA抽出は可能でしょうか?

やってみたところ、一部DNAが抽出できていることが確認できたのですが、全量が抽出できているのか、確信が持てません。
 
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(無題) 削除/引用
No.9997-3 - 2021/10/26 (火) 10:18:02 - G25
用途や目的がわからないことにはいいとも悪いとも言えません。
全量抽出することが重要なのでしょうか。
大概のPCRであれば全量抽出でなくても十分なはずですけれど。

それともmicrobiomeなんかの目的で雑多な細菌の混合物から種間のバイアスがかからないように満遍なく抽出したいということかしらん。だとしたら、どちらの方法も不十分だというのがコンセンサスでしょう。

(無題) 削除/引用
No.9997-2 - 2021/10/26 (火) 07:19:09 - おお
全量抽出ってどのように考えたらいいのか、、、Direct PCRだったらその溶液の中DNAが含まれた状態でPCRかけるわけだから全量使っているわけだし。

効率よい精製法でも全量(100%)取れると思いませんが、効率のいい精製法が必要なら文献やプロトコール集を調べたらいいと思いますが。それかキットを買うか。

フェノクロ抽出やダイレクトPCR溶液で細菌のDNA抽出は可能か 削除/引用
No.9997-1 - 2021/10/25 (月) 22:13:18 - スーも
フェノクロ抽出やダイレクトPCR溶液で細菌のDNA抽出は可能でしょうか?

やってみたところ、一部DNAが抽出できていることが確認できたのですが、全量が抽出できているのか、確信が持てません。

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