全6件 ( 1 〜 6 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.9995-6 - 2021/10/30 (土) 13:46:09 - ii ddPCRで、全RNA当たりの当該mRNAの絶対定量ができるかと思います。 ただseventhさんもおっしゃっているように、mRNA存在比がヒト/ネコで50:1であったとしても、翻訳効率やその下流のシグナル経路によるamplificationの度合いが同じとは考えられないので、その経路のヒト／ネコ間での違いを論じるなら、mRNAだけでなく、下流まで調べ上げる必要が有るのかなと思います。 もしくは生理的な役割が類似している他の遺伝子も網羅的にddPCRで定量していって、当該のmRNAだけやけに種差が大きいのであれば、そういう方向からストーリー展開していくこともできるかもしれません。

(無題) 削除/引用 No.9995-5 - 2021/10/27 (水) 14:04:04 - seventh 言うことは可能だと思いますが、現在のデータだけでは見る人が納得できるかはわかりません。 例えば無処理の発現量が0に近い値なら比率だと過剰に増加してみえるかもしれません。 説を補強できるデータや既知の知見があれば説得力は増すとは思います。

(無題) 削除/引用 No.9995-4 - 2021/10/26 (火) 09:27:45 - トマト 教えていただきありがとうございます。 刺激に対する応答性の傾向がイヌ100,ヒト5000だと、 種間の違いによりこれだけでは確証は得られないものの、ヒトのほうが応答性が高いと考えられる、というような見解はしてよいものでしょう。

(無題) 削除/引用 No.9995-3 - 2021/10/25 (月) 10:41:18 - seventh 種間で発現量を比較するのはほぼ意味ないです。 種間の距離が遠いほど、バックグラウンドの遺伝子ネットワークなどが変わってくるのでそれらを無視して１個の遺伝子の量を見ても意味がありません。 同属別種ぐらい近いなら直接比較する場合もありますが。 応答性の傾向（無処理に比べて処理区は増加するとか）の比較とかなら意味はあるでしょうけど。この場合も3倍と10倍で生物学的に違いがあるかどうかは別の話です。増減が逆とかなら違いがあると推定しても良いとは思いますが。

(無題) 削除/引用 No.9995-2 - 2021/10/23 (土) 21:47:45 - トマト 補足です。 遺伝子Aの発現量を見るにあたって、 細胞を刺激してます。 ヒト細胞、ネコ細胞ともに刺激前後の発現量を相対定量で比較しました。 ヒト細胞では刺激後は5000ほとで、ネコ細胞は刺激後は100ほどの相対量でした。 この値は、ヒト細胞ではより刺激に対して遺伝子の発現量が多いという風に単純に比較できるものでしょうか。

pPCRの解析方法(比較方法)について 削除/引用 No.9995-1 - 2021/10/23 (土) 18:10:20 - トマト こんにちは。 qPCRによってヒト細胞とネコ細胞の遺伝子Aの発現量を比較したい場合、どの値を使用して計算したら良いかわからないため、 ご存知のかた教えていただけますと大変助かります。 今までは、ネコ細胞の遺伝子Aの発現量を個体差で見ていたため、サンプルを相対定量で比較しておりました。 ヒト細胞との比較では使用するプライマーも異なり、相対定量では比較できないと考えております。 よろしくおねがいします。

全6件 ( 1 〜 6 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---