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4重染色をImageJでsplit トピック削除
No.9992-TOPIC - 2021/10/22 (金) 00:40:29 - Yu
ImageJを用いて4重染色したものをsplitしたいのですが、tiff画像を開きそのまま「Image→Color→Split Channels」とすると3色にしか分かれません。
方法をご存知の方、教えてください。宜しくお願いします。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.9992-4 - 2021/10/22 (金) 13:51:50 - Yu
>tiffではなくて、顕微鏡で撮影されたときに作成される生データファイル(Zweissならczi、オリンパスならoibなど)のほうをimagejで開けば分離したシングルチャンネルの図を作成できます。

できました。ありがとうございます。
基本的な質問で申し訳ありませんでした。

(無題) 削除/引用
No.9992-3 - 2021/10/22 (金) 09:42:02 - AA
重ね合わせた1枚絵を色の三要素で分離しただけなので3つに別れるのは当然です。
そもそもこの場合表現されている色は疑似カラーなので、3重染色を3チャンネルに分けてもそれぞれの二次抗体由来のシグナルを表しているわけではありません。(使っている色にもよりますが)

tiffではなくて、顕微鏡で撮影されたときに作成される生データファイル(Zweissならczi、オリンパスならoibなど)のほうをimagejで開けば分離したシングルチャンネルの図を作成できます。

(無題) 削除/引用
No.9992-2 - 2021/10/22 (金) 08:54:07 - s
状況がよくわかりません。何でそれぞれのチャンネルの単色画像がないのでしょう。

RGBという三次元空間の点を四次元空間に一意的にマップするのは数学的に無理だと思いますが。

4重染色をImageJでsplit 削除/引用
No.9992-1 - 2021/10/22 (金) 00:40:29 - Yu
ImageJを用いて4重染色したものをsplitしたいのですが、tiff画像を開きそのまま「Image→Color→Split Channels」とすると3色にしか分かれません。
方法をご存知の方、教えてください。宜しくお願いします。

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