BioTechnicalフォーラム [ImageJでの蛍光強度比較]

https://theolb.readthedocs.io/en/latest/imaging/measuring-cell-fluorescence-using-imagej.html

こういうことが知りたいのでしょうかねぇ。

ちなみにたしか
Brightnessは全体的に下駄をかかせるか、弱いシグナルを足切りするもので、
Contrastはあげるとwwnさんの示したページのグラフでは傾きに相当する。傾きを上げると光量の高い方から飽和していき明らかにその領域では定量性がなくなる。

だから基本いじらないで生データーのままで測定するべき。wwnさんの示したページのグラフではヒストグラムに対角線を引いたようになるという状況。

(無題)

削除/引用

No.9974-5 - 2021/10/14 (木) 14:03:41 - AA

キーエンスのはBZのアナライザーで定量できませんでしたっけ？
キーエンスの担当の人に聞くとかなり詳細に渡って相談に乗ってくれると思います。

(無題)

削除/引用

No.9974-4 - 2021/10/14 (木) 13:12:41 - wwn

輝度を測るといっても具体的に示さないと回答は難しいと思います。
とりあえず、下記サイトのリンクを貼っておきますので参考にどうぞ。
https://imagej.net/imaging/image-intensity-processing

また、https://forum.image.sc で質問するのもいいと思います。

(無題)

削除/引用

No.9974-3 - 2021/10/14 (木) 12:37:36 - せいぶつ

>>おおさん
ご回答いただきありがとうございます。
撮影時の顕微鏡の設定は対象とサンプル間で同一にし、撮影自体は終わっています。ImageJでの画像解析についてお聞きしたいところでした。
言葉足らずで申し訳ありません。

(無題)

削除/引用

No.9974-2 - 2021/10/14 (木) 12:18:02 - おお

機械によってパラメーターのいじり方が違うと思うけど、やるのならマニュアルにしてカメラの露光時間と検出感度（GainやBiningなど）のパラメータを両者で同じにして、Brightness やContrast、Gamma correctionは一切いじらないで（前の人の設定が残っていたら解除が必要かも）データーを取るようにすると比較ができる画像が取れます。
また、KEYENCEに聞けるなら上記のことを操作面でどうしたらいいか話してくれるでしょう。
対象はスライドガラス上ですか、それともMicroplatesとかですか？どっちと言われてもこれ以上操作について話せないけどプレート上で比較対象が同じプレートに乗っているなら同じ条件でスキャンできるのでやりやすいと思います。

ImageJでの蛍光強度比較

削除/引用

No.9974-1 - 2021/10/14 (木) 11:00:22 - せいぶつ

全9件 ( 1 ～ 9 )　前 | 次　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

〔使い方〕

「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。