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リボソームの構造
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No.9967-TOPIC - 2021/10/11 (月) 10:59:48 - 生化学
リボソームの構造(2次構造)をいろいろな角度から見ることができるウェブ、資料、情報を教えてください。具体的には RpS●●のxxx番目のアミノ酸は RpS△△の○○番目のアミノ酸と近い位置にある などの情報を調査したいです。
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No.9967-3 - 2021/10/11 (月) 13:28:17 - WInter-8
PDBjでリボソームと検索すると三次構造がたくさん出てきます。
これでは数が多すぎるので、生物種やサイズなどを限定して検索するのがおすすめです。
PDB ID毎に座標データ(PDBまたはmmcif)をダウンロードすることができます。
PyMolでそれらを表示して重ね合わせ (align A, B) すればわかりやすいと思います。
(無題)
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No.9967-2 - 2021/10/11 (月) 11:53:34 - qq
知りたいのは三次構造ではないだろうか?
PDBでribosomeを探すと、適切そうなのがありませんかね?
必要に応じで、スタンドアロンのビュワーで見るとよいのではないでしょうか?
リボソームの構造
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No.9967-1 - 2021/10/11 (月) 10:59:48 - 生化学
リボソームの構造(2次構造)をいろいろな角度から見ることができるウェブ、資料、情報を教えてください。具体的には RpS●●のxxx番目のアミノ酸は RpS△△の○○番目のアミノ酸と近い位置にある などの情報を調査したいです。
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