Bio Technical フォーラム

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RNA-seqでのRNAの質 トピック削除
No.9948-TOPIC - 2021/10/03 (日) 21:59:05 - モルモル
マウスに癌細胞株を移植した後、回収し、RNA-seqを検討しています。顕微鏡で観察したところ、一部に壊死が起きています。割合としては生細胞が7割で壊死は3割程度と考えます。

実験系の都合上（詳細は割愛）、生細胞と壊死細胞を区別せず、まとめてRNA-seqを行いたいのですが、RNA分解産物も含まれているとなると、RNA-seqは行えないのでしょうか？
　
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(無題) 削除/引用
No.9948-2 - 2021/10/05 (火) 05:03:31 - おお
行えない理由はないと思います、どんな実験系も理想的にはならない限界がありますからその上でのデーターというだけの事だと思います。

RNA-seqでのRNAの質 削除/引用
No.9948-1 - 2021/10/03 (日) 21:59:05 - モルモル
マウスに癌細胞株を移植した後、回収し、RNA-seqを検討しています。顕微鏡で観察したところ、一部に壊死が起きています。割合としては生細胞が7割で壊死は3割程度と考えます。

実験系の都合上（詳細は割愛）、生細胞と壊死細胞を区別せず、まとめてRNA-seqを行いたいのですが、RNA分解産物も含まれているとなると、RNA-seqは行えないのでしょうか？
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