バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「
新しいトピックを作る
」から書き込みをしてください。
質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。
新しいトピックを作る
|
トピック一覧
|
研究留学ネットに戻る
ひとつ前のフォーラム(readのみ)
このスレッドをはてなブックマークに追加
多重検定
トピック削除
No.9771-TOPIC - 2021/06/26 (土) 10:33:56 -
colony
いつも勉強させていただいております。
多重検定のBonferroniの補正についてです。
組織中から30個の分子が見つかったきました。
この時、どの分子の量が変動したかを検定するときに検定の総数は30でしょうか?
Bonferroni補正では。有意水準をα、検定総数をNとしたとき、その有意水準をα/Nまで引き下げるということは理解しておりますが、この場合、「検定総数=見つかってきた分子種の数」と考え方で合っていますでしょうか。
お詳しい方がおられましたら、お教えいただけますと幸いです。
-
このトピックにメッセージを投稿する
-
全
3
件 ( 1 〜 3 ) 前 | 次
1
/
1.
/
1
(無題)
削除/引用
No.9771-3 - 2021/06/26 (土) 15:38:55 -
colony
おお 様
ご回答いただきまして、ありがとうございます。
検出された分子が30種であり、調べた分子種はもっと多くあります。
Bonferroniの補正しか検討しておりませんでしたので、貼っていただいたリンクが非常に役に立ちました。
参考に解析を進めて参ります。
ありがとうございました。
(無題)
削除/引用
No.9771-2 - 2021/06/26 (土) 11:07:02 - おお
「見つかったきました」って具体的にどういうことですか?
たとえば1000個の分子を検討したなら、有意差が出てないものも検定したわけだからα/NのNは1000です。
サンプルサイズが多くなるとBonferroniなどの補正は検出感度を大きく下げてしまい、それを補うには実験をリピートするにしてもかなりリピートすることになるだろうし、現実的ではありません。
FDRを使うことをおすすめします。
https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp/~tohhiro/dataScience/dataScience3.pdf
あるいはスクリーニングだと割り切って、セレクトした分子を個々で検討するか。
多重検定
削除/引用
No.9771-1 - 2021/06/26 (土) 10:33:56 -
colony
いつも勉強させていただいております。
多重検定のBonferroniの補正についてです。
組織中から30個の分子が見つかったきました。
この時、どの分子の量が変動したかを検定するときに検定の総数は30でしょうか?
Bonferroni補正では。有意水準をα、検定総数をNとしたとき、その有意水準をα/Nまで引き下げるということは理解しておりますが、この場合、「検定総数=見つかってきた分子種の数」と考え方で合っていますでしょうか。
お詳しい方がおられましたら、お教えいただけますと幸いです。
全
3
件 ( 1 〜 3 ) 前 | 次
1
/
1.
/
1
パスワード
を入力してチェックした記事を
チェックした記事を
このトピックにメッセージを投稿する
名前
メール
アドレス非公開
タイトル
本文
設定
クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証
半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信
〔使い方〕
「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。