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分泌タンパク質発現細胞のフローサイトメトリーの原理について トピック削除
No.9761-TOPIC - 2021/06/21 (月) 00:37:28 - たけい
いつも勉強させて頂いております。
一点お伺いさせてください。

あるタンパク質をコードする遺伝子を細胞にトランスフェクション後、目的タンパク質の発現をフローサイトメトリ―で検証しようと考えています。
先行研究を参考にしながら抗体やプロトコルを準備しました。
この実験の原理なのですが、タンパク質発現を固定化・透過処理せずに抗体で検出できるのはどう考えれば良いのでしょうか?
個人的には標題に記載したように、分泌用のシグナル配列が含まれているためと考えていますが、正しいでしょうか?
あるいは、多くの細胞に発現しているMHCI分子によって抗原提示され、そこに抗体が結合するために測定可能ということでしょうか?
また、一つ目の原理だとすると、逆にシグナル配列がない場合は固定化・透過処理をしないとフローサイトメトリーは使えないということになりますでしょうか?

皆さんプロのご意見を頂けますと幸いです。
よろしくお願い申し上げます。
 
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(無題) 削除/引用
No.9761-2 - 2021/06/21 (月) 04:26:22 - おお
分泌用のシグナル配列といえどER内に蛋白を挿入されたあとにすぐ切れるものも少なくはないと思うけど、それでもなおさら分泌用のシグナル配列にこだわるのがわかりませんが、私がなにか見落としているでしょうか。

分泌するものが細胞表面にあるのは、そのタンパク質が細胞表面にアフィニティーがあってある程度はそこにとどまっている(もしかしたら培養とか細胞周辺の環境も手伝って)かあるいは、細胞表面でも膜にとどまっていて(TMドメインが残っているなど)、放出されるには何らかのステップが必要なためといえるのではとおもいます。

あなたの目的のタンパク質が以前の研究で細胞にラベルが可能ならできる可能性はあるかもしれませんが、細胞の分泌量をどの程度反映しているのかなど冷静に見ていく必要はあると思います。

じっさい分泌蛋白をFACSなどで検出するのにいくらか工夫した方法論が発表されているので、ちゃんとラベルされないものもあるのではないでしょうか。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/cyto.a.22200

分泌タンパク質発現細胞のフローサイトメトリーの原理について 削除/引用
No.9761-1 - 2021/06/21 (月) 00:37:28 - たけい
いつも勉強させて頂いております。
一点お伺いさせてください。

あるタンパク質をコードする遺伝子を細胞にトランスフェクション後、目的タンパク質の発現をフローサイトメトリ―で検証しようと考えています。
先行研究を参考にしながら抗体やプロトコルを準備しました。
この実験の原理なのですが、タンパク質発現を固定化・透過処理せずに抗体で検出できるのはどう考えれば良いのでしょうか?
個人的には標題に記載したように、分泌用のシグナル配列が含まれているためと考えていますが、正しいでしょうか?
あるいは、多くの細胞に発現しているMHCI分子によって抗原提示され、そこに抗体が結合するために測定可能ということでしょうか?
また、一つ目の原理だとすると、逆にシグナル配列がない場合は固定化・透過処理をしないとフローサイトメトリーは使えないということになりますでしょうか?

皆さんプロのご意見を頂けますと幸いです。
よろしくお願い申し上げます。

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