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(無題) 削除/引用 No.9722-2 - 2021/06/04 (金) 13:40:37 - AA 質問者さんの抱かれたイメージは正しいです。 dCasとデアミナーゼなどの酵素の物理的な距離によって、 ガイド配列のどの塩基付近が編集されやすい、 というのはありますが、例えばGGGと言うコドンをGAGに変える、というのは難しいです。 (もちろん試してみたらたまたま取れることはありえますが) dCasの結合部位をずらす対応になりますが、PAMがなかったり効率の悪い認識配列であればそれ自体が原因でうまく行かなくなります。 なので、難しい配列の編集の場合はprime editingなど、別の方法論を取ったほうが良いと思います。

CRISPR/Cas9塩基エディターCBEとABEに関して 削除/引用 No.9722-1 - 2021/06/02 (水) 23:28:09 - のーぶ 現在CRISPR/Cas9システムを勉強している学部生です。 最近一塩基置換を起こせるCBE（C:GをT:A変換）とABE（A:TをG:C変換）の存在を知りました。 大まかな原理は分かったのですが、置換を起こすEditing windowの中に、目的の塩基以外の同塩基が存在している場合、どうやって目的の塩基だけターゲットしてくれるのかが気になります。（例：AGCAAの4塩基目のAを変えたい場合、１，５塩基目のAもターゲットになるのではないかと思います） その場合は、PAM配列を変えてEditing windowの位置をずらすしかないのでしょうか？その場合でもoff-targetになったりとうまく行かない時は多いのでしょうか？（効率が悪そうなイメージなので...） 有識者の方、また、参考になる文献などありましたら是非教えて頂きたいです。 初めて利用させて頂くので失礼がありましたら、また、場違いな質問でしたら申し訳ございません。もし教えて頂けたら大変助かります、どうぞよろしくお願い致します。

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