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(無題) 削除/引用 No.9690-2 - 2021/05/20 (木) 00:44:15 - おお >A vs B vs Cのような比較で、DEG(異なる発現レベルの遺伝子)を特定したい 分散分析を思い浮かべるのだけど 分散分析の帰無仮説 「各群の母平均は等しい」 https://bellcurve.jp/statistics/course/10006.html 遺伝子、蛋白のすべてが対象になると思いますので（例えば１０００の遺伝子を比較した場合Bonferroniであればp値を１０００倍するとか）、多重比較補正の代わりにFDRを使ったりと統計手法に工夫がいるかも知れませんが、そこのところは詳しくはわかりません。

プロテオーム解析などオミクス解析の３群比較 削除/引用 No.9690-1 - 2021/05/19 (水) 15:48:38 - nm プロテオーム、RNAseq,などのオミクス系解析で、 ３グループ以上の比較をする際は、どのような統計手法を使うべきでしょうか？ n=4程度のサンプル数のグループが、３グループあり、 A vs B, A vs Cのような比較でなく、 A vs B vs Cのような比較で、DEG(異なる発現レベルの遺伝子)を特定したいと考えています。 ２群比較だと、t-testをしてp値補正をかけるのが一般的だと思うのですが 3群以上で良い方法を探しております。 ご存知でしたら教えていただけるとありがたいです。

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