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(無題) 削除/引用 No.966-2 - 2012/09/27 (木) 23:04:11 - おお 超音波で焦げますか、、、温度がコントロールされていれば大丈夫だと思うのですが。。。焦げるほどだと干上がっているように思えますけど。 もしなんなら5sx60とかインターバルの時間を長くするとかで温度が上がらないようにすればいいかと。

sonication後の黒いカス 削除/引用 No.966-1 - 2012/09/27 (木) 22:19:57 - ダメット ChIPを始めるように言われ、現在条件検討を行っています。 細胞はヒトのfibro 6x10^7個で行っています。ソニケーションにはブランソンの450 sonifierを 使用しています。lysisは300ulです。 ソニケーションを行い、最適なDNA断片化条件を見つけようとしている のですが、あまりにも細胞の断片化ができないため、OUTPUT 7 dutycycle 90で10sec x30 行いました。遠心後、黒い細胞片がでてきました。断片化はうまくいったのですが、細胞が焦げ付いたということは、当然クロスリンクしたタンパクも変性してしまったと考えるのが 妥当でしょうか？この条件で初めて最適な断片化が行えたのですが、このままChIPを行う のには不安が有ります。研究室でだれもChIPを行っていないため、どなたかアドバイスお願い致します。

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