Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

DT40以外の細胞で相同組替えはなぜ起こしにくいのか? トピック削除
No.962-TOPIC - 2012/09/25 (火) 20:06:35 - まさ
みなさん教えてください。
現在、ターゲティング技術について勉強中の浅学者です。

KOマウスを作製する際に、targetingコンストラクトとゲノムとの間で相同組替えを起こさせるかと思います。

しかし、通常の培養細胞で遺伝子の機能を調べるにはほとんどがRNAiによるノックダウンかと思います。なぜ、ノックアウトはやられないのでしょうか?

DT40を使うとノックアウトしやすいのはなぜなのでしょうか?

稚拙な質問で恐縮ですが、どうかヒントだけでもご教示いただけませんでしょうか?
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.962-6 - 2012/09/26 (水) 00:05:57 - まさ
Harmoniaさま モモさま

2つのアレルを潰さなくてはいけないので手間がかかるとのこと、大変わかりやすく、納得がいくご回答をありがとうございました。

小言幸兵衛さま
なるほど鳥類が由来ですからGCは確かに相同組替え効率をあげますね。

みなさま本当にありがとうございました。
またもう少し調べてみます。

(無題) 削除/引用
No.962-5 - 2012/09/25 (火) 21:58:36 - モモ
NHEJです・・・

(無題) 削除/引用
No.962-4 - 2012/09/25 (火) 21:56:54 - 小言幸兵衛
DT40で相同組換えの頻度が高いのは、B細胞の抗体遺伝子で高頻度で起こるgene conversionのための機構が使われるからではないでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.962-3 - 2012/09/25 (火) 21:48:18 - モモ
ノックアウトを作るのは時間も手間もお金もかかるので、そこまでしないんじゃないでしょうか?細胞作るだけで半年もかかるんではねぇ。

人の細胞でもHCT116なんかは良くノックアウトが作られてますよね。

NEHJを一時的に抑えることでノックアウトを作る効率がよくなるっていう論文もあった気が。

(無題) 削除/引用
No.962-2 - 2012/09/25 (火) 21:36:58 - Harmonia
DT40でなぜ遺伝子ノックアウト効率が高いのかは分かりません。

一方、常の培養細胞でノックダウンが多いのは、お手軽さからだと
思います。遺伝子を完全にノックアウトするには、父方母方両方の
遺伝子をノックアウトしなければいけませんので、片方をつぶして、
その後でもう片方をつぶす、という手順になります。
ノックダウンでは、遺伝子の産物をたたくので、それこそマルチコ
ピーの遺伝子でも、設計しだいで1回でノックダウンできますので。

DT40では、1回の操作で、父方母方両方の遺伝子をノックアウトで
きるのですか?

DT40以外の細胞で相同組替えはなぜ起こしにくいのか? 削除/引用
No.962-1 - 2012/09/25 (火) 20:06:35 - まさ
みなさん教えてください。
現在、ターゲティング技術について勉強中の浅学者です。

KOマウスを作製する際に、targetingコンストラクトとゲノムとの間で相同組替えを起こさせるかと思います。

しかし、通常の培養細胞で遺伝子の機能を調べるにはほとんどがRNAiによるノックダウンかと思います。なぜ、ノックアウトはやられないのでしょうか?

DT40を使うとノックアウトしやすいのはなぜなのでしょうか?

稚拙な質問で恐縮ですが、どうかヒントだけでもご教示いただけませんでしょうか?

6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。