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LePGcatとLeActinの読み方 トピック削除
No.9541-TOPIC - 2021/02/25 (木) 19:29:26 - 卒論発表がんばるぞ!!
こんばんは

リアルタイムPCRでポリガラクツロナーゼ遺伝子のLePGcatを用いて測定しています。
ここで質問なのですが、LePGcatと内部標準遺伝子であるアクチン遺伝子のLeActinの読み方を教えて頂きたいです。
(私は"エルイーピージーシーエーティー"と"エルイーアクチン"だと思っています)

所属している研究室は遺伝子関連はあまり活発ではないので、聞ける人がいないため、質問させていただきました。

また、catについて分かる方がいらっしゃいましたら、そちらの意味も教えて頂けると助かります。
 
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(無題) 削除/引用
No.9541-14 - 2021/02/26 (金) 18:51:40 - おお

> おお様 
> 教えて頂き、誠にありがとうございます。
>
> 大変申し訳ないのですが、触媒サブユニットとは何を表しているのでしょうか。

どうやら生化学の授業をやらないと理解してもらえなさそうで、こんなところで授業とか成り立つわけないから説明は無理です。

ググってこんなのと言っても、偏った見方されてもお互い不幸だし。

>
> また、LePGcatとLePGは別物でしょうか。
>

私の専門外なので、それに関する研究のヒストリーまで見ていかないと答えられません。今そんなに時間はないですし。

(無題) 削除/引用
No.9541-13 - 2021/02/26 (金) 18:14:42 - 卒論発表がんばるぞ!!
>[Re:12] おおさんは書きました :
>Catalitic Subunitということだと思うけど。

おお様 
教えて頂き、誠にありがとうございます。

大変申し訳ないのですが、触媒サブユニットとは何を表しているのでしょうか。

また、LePGcatとLePGは別物でしょうか。

初歩的な質問ばかりで申し訳ございません。

(無題) 削除/引用
No.9541-12 - 2021/02/26 (金) 17:27:11 - おお
>つまりLePGcatはトマトのPG遺伝子の発現を触媒する遺伝子ということでしょうか。

違うと思うCatalitic Subunitということだと思うけど。

(無題) 削除/引用
No.9541-11 - 2021/02/26 (金) 15:08:05 - 卒論発表がんばるぞ!!
catについて調べました。

catalyticのcat=触媒
つまりLePGcatはトマトのPG遺伝子の発現を触媒する遺伝子ということでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.9541-10 - 2021/02/26 (金) 13:28:52 - 卒論発表がんばるぞ!!
おお様、cat様
様々なご意見を頂き、ありがとう御座います。

このプライマーの情報は論文から引っ張って用いました。
また、トマトは実を使ってqPCRを行いました。

リアルタイムPCR関連の実験は所属している研究室では私が初めてで、調べ方も分からず、このサイトでお聞きしました。お二人のご意見のとおり、私がもっと調べるべきでした。

どちらのプライマーも既存のものを購入しました。

(無題) 削除/引用
No.9541-9 - 2021/02/26 (金) 05:51:45 - おお
catについて
PMCID: PMC219044
PMID: 12972668

(無題) 削除/引用
No.9541-8 - 2021/02/26 (金) 03:32:04 - cat
>[Re:5] catさんは書きました :
> 私だったらLeを飛ばして「ぴーじーキャット、アクチン」と呼んで、指摘されたら変えるかなと思いました。なるほど、レップGキャットのほうがいいかもですね。アクチンはとりあえずレアクチンで。

あるいは「れぴーじーキャット、レアクチン」かな。

(無題) 削除/引用
No.9541-7 - 2021/02/26 (金) 03:22:06 - cat
>[Re:6] おおさんは書きました :
> >[Re:5] catさんは書きました :
> > 、LeavesのLeかと思ってました。茎や種子でなく葉っぱだよ、と区別するものなのかなー?、と。
>
> わたしは外野なのでその可能性は100%否定できませんよ。

そうですか。ではご存知の方か卒論発表がんばるぞ!!さんからのコメントを待ちます。

(無題) 削除/引用
No.9541-6 - 2021/02/26 (金) 03:13:56 - おお
>[Re:5] catさんは書きました :
> >[Re:3] おおさんは書きました :
> 、LeavesのLeかと思ってました。茎や種子でなく葉っぱだよ、と区別するものなのかなー?、と。

わたしは外野なのでその可能性は100%否定できませんよ。

(無題) 削除/引用
No.9541-5 - 2021/02/26 (金) 03:10:23 - cat
>[Re:3] おおさんは書きました :

> あたまのLEはLycopersicon esculentumすなわちトマトから来ているのですね。

Leが何なのかの方が気になってました。なるほど、Lycopersicon esculentumnaなのですね。検索してトマト関係、植物関係とはわかったのですが、LeavesのLeかと思ってました。茎や種子でなく葉っぱだよ、と区別するものなのかなー?、と。

> エルイーピージーシーエーティーと行っても構わんけど長ったらしくて読みにくいので、なんの知識もなくそれを読めと言われるとレップGキャットだけど。Pは意味的にはLEと離れているし、アクチンではそういう意味で困ったことになる。

私だったらLeを飛ばして「ぴーじーキャット、アクチン」と呼んで、指摘されたら変えるかなと思いました。なるほど、レップGキャットのほうがいいかもですね。アクチンはとりあえずレアクチンで。

(無題) 削除/引用
No.9541-4 - 2021/02/26 (金) 02:45:12 - おお
>catについて分かる方がいらっしゃいましたら、そちらの意味も教えて頂けると助かります。

あとで読み返したんだけど、、、知らんかったんか!ってちょっとびっくりだわ。知らん遺伝子扱ってたんかって思った。

(無題) 削除/引用
No.9541-3 - 2021/02/26 (金) 02:42:45 - おお
読み方は決まっているようで決まってないので、ラボやその研究フィールドでどう読んでいるか探るほうがいいのかもしれません。そういう意味では外野の意見は当てにならないとまで言いませんが、外しているかもしれません。ただし外しているから間違えというわけでもなく、相手がわかるという前提さえ成り立てばそれでもいいです。ただこう読みなさいと指導があるならそれを優先するのが礼儀でもあると思います。

あたまのLEはLycopersicon esculentumすなわちトマトから来ているのですね。ならばLeActinはトマト、アクチンでもいいです。同様に LEPGcatはトマトPolygalacturonaseですよね。PGcatはラボでどう読んでるか聞いてみたらと思います。
あるいは研究対象がすでにわかっているのならその中の話なのでアクチン、Polygalacturonaseといっても支障がありません。

読み方であえてここでもう一つ言うなら、SV40と書いているのをみて、読むときはフルネームでいうことがあります(simian virus 40)。なのでわかんなかったらフルでよめという理屈も成り立つわけで、Lycopersicon esculentum アクチンでもいいという話で、Lycopersicon esculentumが長いとか言いにくいからトマトと置き換えたという話。

エルイーピージーシーエーティーと行っても構わんけど長ったらしくて読みにくいので、なんの知識もなくそれを読めと言われるとレップGキャットだけど。Pは意味的にはLEと離れているし、アクチンではそういう意味で困ったことになる。

(無題) 削除/引用
No.9541-2 - 2021/02/26 (金) 01:32:09 - cat
>[Re:1] 卒論発表がんばるぞ!!さんは書きました :
> こんばんは
>
> リアルタイムPCRでポリガラクツロナーゼ遺伝子のLePGcatを用いて測定しています。
> ここで質問なのですが、LePGcatと内部標準遺伝子であるアクチン遺伝子のLeActinの読み方を教えて頂きたいです。
> (私は"エルイーピージーシーエーティー"と"エルイーアクチン"だと思っています)
>
> 所属している研究室は遺伝子関連はあまり活発ではないので、聞ける人がいないため、質問させていただきました。

教授に聞いたらどうです?

>
> また、catについて分かる方がいらっしゃいましたら、そちらの意味も教えて頂けると助かります。

既存のプライマーを購入してたらその会社でプライマーについての説明があるでしょうからそこに載ってませんか?自作でしょうか?ちなみに検索したらすぐに出てきましたが。意味もわからずPCRしたんですか?

卒論発表頑張ってくださいね。

LePGcatとLeActinの読み方 削除/引用
No.9541-1 - 2021/02/25 (木) 19:29:26 - 卒論発表がんばるぞ!!
こんばんは

リアルタイムPCRでポリガラクツロナーゼ遺伝子のLePGcatを用いて測定しています。
ここで質問なのですが、LePGcatと内部標準遺伝子であるアクチン遺伝子のLeActinの読み方を教えて頂きたいです。
(私は"エルイーピージーシーエーティー"と"エルイーアクチン"だと思っています)

所属している研究室は遺伝子関連はあまり活発ではないので、聞ける人がいないため、質問させていただきました。

また、catについて分かる方がいらっしゃいましたら、そちらの意味も教えて頂けると助かります。

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