Bio Technical フォーラム

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マイクロアレイのIDをEnsemble IDに変換したい トピック削除
No.9506-TOPIC - 2021/02/14 (日) 12:58:58 - ひとりぼっち
サーモフィッシャーのマイクロアレイ（Clariom S Human）の結果が返ってきました。
機能解析を行うためPANTHERを使おうとしたところ、対応するIDではなかったので、ID変換をする必要がありました。

手元のIDは以下のようなものです。

TC2200007312.hg.1


ID変換のために、DAVIDのGene Accession Conversion Toolを使おうとしたのですが、識別子？が不明という理由で変換が失敗します。

このTC〜から始まりhg.1で終わるIDをensemble IDに変換する方法を教えてください。よろしくお願いいたします。
　
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(無題) 削除/引用
No.9506-2 - 2021/02/14 (日) 13:57:59 - s
Affimetrixに問い合わせるべきかもしれませんが、一応ここにprobe IDとofficial gene symbolの対応表があります。

https://www.google.com/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=&ved=2ahUKEwiW4fK7yejuAhWMGKYKHb9LC08QFjACegQIAxAC&url=https%3A%2F%2Fdata.broadinstitute.org%2Fgsea-msigdb%2Fmsigdb%2Fannotations_legacy%2Funconverted_chips%2FClariom_S_Human.r1.chip&usg=AOvVaw3WkWJ_nisxcJywdndpJNug

自分がClariom S Humanを外注した会社では、結果にgene symbolも含まれていました。

マイクロアレイのIDをEnsemble IDに変換したい 削除/引用
No.9506-1 - 2021/02/14 (日) 12:58:58 - ひとりぼっち
サーモフィッシャーのマイクロアレイ（Clariom S Human）の結果が返ってきました。
機能解析を行うためPANTHERを使おうとしたところ、対応するIDではなかったので、ID変換をする必要がありました。

手元のIDは以下のようなものです。

TC2200007312.hg.1


ID変換のために、DAVIDのGene Accession Conversion Toolを使おうとしたのですが、識別子？が不明という理由で変換が失敗します。

このTC〜から始まりhg.1で終わるIDをensemble IDに変換する方法を教えてください。よろしくお願いいたします。
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