zinc finger proteinのChIP-seqの結果の解釈に難渋しています。かなりマイナーなzinc fingerなのですが、予備実験でh3me27が上手く行っていたので、そのままこのzinc fingerに関してもChIPseqを行いました。もちろん波形は出てくるのですが、h3me27と比較して、バックグラウンドが高く、強弱が少なく、明確な結合領域のパターンが解釈しずらいです。
実際問題として、このタンパク質はこういう結合パターンが真実である可能性もあるのですが、最終的にどうやって詰めたらいいのでしょうか?
ウエスタンでは、明確なシングルバンドが出ているので、抗体の特異性は問題ないと考えております。 |
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