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論文に載せないデータについて トピック削除
No.9371-TOPIC - 2020/12/11 (金) 06:35:53 - データの開示請求
質問させてください。

興味ある論文を読んでいて、ある細胞から放出される分子の質量分析を行い、100ほどのタンパク質を同定し、そのうち分子Xに着目して解析を進めたとありました。

ただ100のリストは公開されていませんでした。
この場合、著者に連絡して、100のリストの開示を依頼することは可能でしょうか？あるいは著者にとってリクエストがあれば開示しなければならない義務を負うでしょうか？
もちろん載せたくないという想いは理解できますが、他にどういった分子が同定されていたのか気になってサプリを見ましたが、載っていませんでした。
　
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No.9371-7 - 2020/12/15 (火) 23:15:31 - あqswでfrγ
とりあえず聞いてみないことには話が始まらないのだから、まずはとりあえず聞いてみましょう。

(無題) 削除/引用
No.9371-6 - 2020/12/11 (金) 12:31:30 - TK-1
MSのraw dataはPRIDEとかのdepositoryに入っていないですか？

そこからどういう基準で１００に絞ったかはペーパーに書いてあるでしょうから、自分で解析できないですか。

(無題) 削除/引用
No.9371-5 - 2020/12/11 (金) 10:52:13 - qqq
all data from the manuscriptの指す範囲はallといってもその論文のメインとして論じている分子Xに関することであって、残り99種に関してではないと思う。
が、礼儀正しく聞くだけ聞いてみることには何の問題もないと思います。
ある程度は教えてくれる可能性もある。
向こうが別の論文にする予定で出せないなら断るだけでしょう(大概並行していくつか解析して結果が出たものから論文化するし)。
大上段に「教えろ、教えるのが義務だ」と言ったら何じゃこいつとなるだけです。著者にとって読者は神様なお客様じゃないですからね。

(無題) 削除/引用
No.9371-4 - 2020/12/11 (金) 10:05:15 - データの開示請求
棒次郎さん、ど素人さん
ありがとうございます。

Data availabilityの項には
All data from the manuscript are available from the corresponding author on request.

と書かれてありますが、この範疇にリストの開示が含まれるのではないかと考えていましたが、ど素人さんのコメントを読み、難しそうだなという印象を受けました。

ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.9371-3 - 2020/12/11 (金) 09:32:39 - ど素人
最近のジャーナルでは、論文のところに data availability statements というのを付けることがありますね。その場合は、どのような条件で著者がデータを提供するかがあらかじめ示されています。

ありがちなのは "Data are available from the authors upon reasonable request" みたいな表現だと思います。 reasonable の部分がケースバイケースのあいまいさを残していますが。

遺伝情報などでも、当該論文の根拠として必要なデータであれば、公開の義務があると思います。そうでなければ、義務はないと思います。別の論文のデータになるかもしれませんし、その場合は公開できないですね。

結論としては、「自分の要求が reasonable と思われる場合には、著者にコンタクトしてみる」が正解かと思います。

(無題) 削除/引用
No.9371-2 - 2020/12/11 (金) 08:02:18 - 棒次郎
知りたいという気持ちはわかります。
お願いはできると思います。

強制はできないでしょう。
義務とするなら根拠が必要です。根拠、ありますか？

論文に載せないデータについて 削除/引用
No.9371-1 - 2020/12/11 (金) 06:35:53 - データの開示請求
質問させてください。

興味ある論文を読んでいて、ある細胞から放出される分子の質量分析を行い、100ほどのタンパク質を同定し、そのうち分子Xに着目して解析を進めたとありました。

ただ100のリストは公開されていませんでした。
この場合、著者に連絡して、100のリストの開示を依頼することは可能でしょうか？あるいは著者にとってリクエストがあれば開示しなければならない義務を負うでしょうか？
もちろん載せたくないという想いは理解できますが、他にどういった分子が同定されていたのか気になってサプリを見ましたが、載っていませんでした。
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