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(無題) 削除/引用 No.9319-2 - 2020/11/26 (木) 19:25:34 - 橘 単純にカバレッジが足りないか、ショートリードなら苦手な配列があって読まれてない。 また、実はコンタミしてた、ということもよくあります(というかコンタミゼロなんてよほど低カバレッジのデータでしか見たことない)。 ロングリードで十分なカバレッジがあれば、コンティグを復元することはいまや難しくはないです(ゲノムサイズによる)。 具体的に何やったか書いてないんで言えるのはこれくらいですね。 しかし解読する前に知っておくべきレベルの内容かと思います。 というか、こういうのはSEQanswersとかで訊いた方がいいですよ。

de novoアセンブリについて（初心者） 削除/引用 No.9319-1 - 2020/11/19 (木) 18:49:24 - だる 単一の環状ゲノムを解読するため、次世代解析を行いました。 得られたリードをアセンブリしたのですが、結果が複数のコンティグに分かれてしまいます。 単一のゲノム由来なのだから、1つのコンティグになって欲しいと思うのですが、難しいのでしょうか？

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