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FFPEからのRNA抽出 トピック削除
No.9238-TOPIC - 2020/10/19 (月) 18:58:11 - rin
FFPE組織から、NucleoSpin totalRNA FFPE XSを使用してRNAを抽出する予定です。

IHC用に薄切してうまくきれなかった切片をRNA抽出に回すつもりなのですが、
薄切した切片はRNA抽出を行うまでどのくらいの期間保存できるか、また保存は何度が良いか、ご存知の方がいたら教えていただきたいです。

FFPEからのRNA抽出は初めてでよろしくお願いいたします。
 
 
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No.9238-9 - 2020/11/06 (金) 11:59:36 - rin
ありがとうございます。
勉強になりました。

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No.9238-8 - 2020/11/05 (木) 15:46:45 - ema
私は次の週くらいにまとめて程度の経験です。
1カ月も試したことは無いので、大丈夫とは言えません。
試薬の内容が脱パラなのでキシレンで無いとはいえ、1カ月入れっぱなしは不安です。でしたら、切片のままの方が良いと思います。

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No.9238-7 - 2020/11/04 (水) 18:55:53 - rin
ありがとうございます。
勉強になりました。

>すぐにできない時はParaffin Dissolver 4℃にしていました。
1ヶ月ほどParaffin Dissolverにつけておいても大丈夫でしょうか。

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No.9238-6 - 2020/10/26 (月) 20:36:38 - ema
すぐにできない時はParaffin Dissolver 4℃にしていました。

FFPEのサンプルのRNAは非常に分解していますが、後実験の手法は大丈夫ですか?
既にFFPEの時点で分解しているので、冷凍してもあまり変化が無いと思います。
「IHC用に薄切して」in situ用にブロック作成、薄切(RNaseに気を付けて固定包埋、伸展の水もRNaseに気を付ける)を行っているなら良いのですが普通の包埋方法でRIN3以下というのはざらです。

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No.9238-5 - 2020/10/23 (金) 08:47:16 - おお
ちょっとキットの構成がわからないのですが、Extraction用のBufferしだいではその中に掘り込んでおいてー80保存というのもありかと。

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No.9238-4 - 2020/10/22 (木) 19:47:10 - rin
ありがとうございます。

>RNAならそのまま抽出しちゃったほうがいいかなとは思うけど、そうじゃないなら冷凍庫いれとくかな

時間の都合で、薄切してすぐ抽出が難しく。薄切した状態で保存できらなら暫く保存したいなと思いました。


>FFPEはスライスしてもFFPEだという認識なのですが、間違ってますか?気になるならー80に入れてください。

薄切すると組織の面が剥き出しになるのでパラフィンブロックのようには保存できない、と聞いたことがありまして。ただそれがどのぐらいのレベルの話なのかは全然分からず。やはり-80度に入れた方が安心ですかね。

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No.9238-3 - 2020/10/21 (水) 02:33:30 - おお
FFPEはスライスしてもFFPEだという認識なのですが、間違ってますか?気になるならー80に入れてください。

(無題) 削除/引用
No.9238-2 - 2020/10/20 (火) 12:41:16 - aa
RNAならそのまま抽出しちゃったほうがいいかなとは思うけど、そうじゃないなら冷凍庫いれとくかな

FFPEからのRNA抽出 削除/引用
No.9238-1 - 2020/10/19 (月) 18:58:11 - rin
FFPE組織から、NucleoSpin totalRNA FFPE XSを使用してRNAを抽出する予定です。

IHC用に薄切してうまくきれなかった切片をRNA抽出に回すつもりなのですが、
薄切した切片はRNA抽出を行うまでどのくらいの期間保存できるか、また保存は何度が良いか、ご存知の方がいたら教えていただきたいです。

FFPEからのRNA抽出は初めてでよろしくお願いいたします。
 

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