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ナノポアかPacBioか 削除/引用 No.9139-1 - 2020/09/04 (金) 22:32:43 - ナノ お世話になっております。 現在3000bpほどのDNAライブラリーを解析したいと考えています。 （DNAの分割は諸事情により不可。） IlluminaのNGSで解析しようと考えていたのですが、3000bpのような大きなDNAだと解析できないとのご指摘を頂きました。 そこでOxford nanopore sequencerかPacBioのNGSを検討しておりますが、これらのNGSを実際に使ったことがある方はいらっしゃいますか？ ご意見をお聞かせ頂けると大変有り難いです。 Nanoporeは若干エラー率が高いと聞きました。 エラー率が低いことに越したことはないですが、リード数を多くすれば、クラスタリングによって正しい配列も分かるのかなと思っています。 また、PacBioの外注コストを調べてみましたが、 かなり高いのでコスト面を見ればNanoporeの方がいいのかなとも考えております。

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