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(無題) 削除/引用 No.9136-5 - 2020/09/04 (金) 01:15:57 - おお 例えばpETシリーズのRBSからATG直前までの配列を参考にすればいいかと思います。RBS以外は実際はコンセンサスはないかもしれませんが、ある程度のプレファレンスはある可能性は考慮してもいいかもしれませんのでATG直前とかは同じ配列にしておくといいかもしれません。たしかNde IかNcoIで切れるようになっていると思います。

(無題) 削除/引用 No.9136-4 - 2020/09/03 (木) 22:49:59 - G25 原核生物と真核生物ではリボゾームがmRNAに結合し開始コドンを見分ける仕組みが違うのに、大腸菌に真核生物のルールを持ち込んでどういうつもりだ？と思いますね。 ちなみSD配列とは原核生物のRBSと同義。

(無題) 削除/引用 No.9136-3 - 2020/09/03 (木) 22:40:54 - G25 Kozak配列は真核生物のコンセンサスなので道理はない。 入れたことによってたまたま、正あるいは負の効果がを生じるかもしれないが、余計なことだろう。 ちなみにKozakのコア配列のコンセンサスは、 ccRccATGg (ATGは開始コドン、小文字は保存性が高くない)

(無題) 削除/引用 No.9136-2 - 2020/09/03 (木) 22:28:40 - とめ GccAccでやってます。

コザック配列の入れ方について 削除/引用 No.9136-1 - 2020/09/03 (木) 21:43:34 - kao シャインダルガノ配列・リボソーム結合部位・コザック配列の違いを教えていただきたいです。 大腸菌タンパク精製で使うDNAにコザック配列を入れたほうがいいと言われました。発現ベクターには、目的遺伝子を導入予定の箇所の１０塩基ほど前に制限酵素サイトを挟んでリボソーム結合部位が存在します。RBSと近い位置にコザック配列を入れてもいいものなのでしょうか？ コザック配列がどういう配列なのか調べても具体的な配列が見つからなかったのですが、具体的な配列は存在しないのでしょうか？開始コドンの直前にAGGAGGを入れるという方法で合っていますでしょうか？（制限酵素サイト-AGGAGG-ATG-目的遺伝子配列　の順で設計予定です）

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