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細胞内とエクソソーム内のmRNA発現量の比較とその考え方について トピック削除
No.8835-TOPIC - 2020/05/09 (土) 16:01:05 - RNAシークエンス
細胞とエクソソームサンプルに対してRNAseqをかけた場合、両者の遺伝子発現レベルはFPKMやRPKM, TPMで補正して発現量を比較できるものなのでしょうか?

細胞内に比べて、エクソソーム内のmRNAの量はかなり少ないと思います。
ですので細胞とエクソソームの遺伝子発現量を比較すると全部とは言い切れませんが、その多くが細胞>エクソソーム になると思います。

実際問題、細胞とエクソソーム の遺伝子発現量を比較することは可能なのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.8835-2 - 2020/05/09 (土) 17:12:02 - おお
エクソソーム内のmRNA発現量という言い方は個人的にはすっきりしませんが、ちょっと冷静に何が見たいのか落ち着いて考えてみてください。

という事でその先はとりあえずは書きません。大抵これでいいという事はいえますが、それも目的しだいで間違えともいえますので。

細胞内とエクソソーム内のmRNA発現量の比較とその考え方について 削除/引用
No.8835-1 - 2020/05/09 (土) 16:01:05 - RNAシークエンス
細胞とエクソソームサンプルに対してRNAseqをかけた場合、両者の遺伝子発現レベルはFPKMやRPKM, TPMで補正して発現量を比較できるものなのでしょうか?

細胞内に比べて、エクソソーム内のmRNAの量はかなり少ないと思います。
ですので細胞とエクソソームの遺伝子発現量を比較すると全部とは言い切れませんが、その多くが細胞>エクソソーム になると思います。

実際問題、細胞とエクソソーム の遺伝子発現量を比較することは可能なのでしょうか?

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