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splicingについて
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No.8831-TOPIC - 2020/05/08 (金) 12:31:07 -
うさぎ
いつも質問させていただいております。
splicingについての質問です。
転写後に間のintronやexonを除去して様々なtranscriptを作りますが
間ではなく端っこの5'末端(5'UTRやexon1)がsplicingで切り落とされる可能性はありえますでしょうか。
詳しい方がいらっしゃいましたらお教えいただけますと幸いです。
よろしくお願い致します。
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No.8831-3 - 2020/05/09 (土) 20:02:35 -
うさぎ
ありがとうございます。
転写開始点が異なっているかを調べるために5´RACEをしてみることになりました。
(無題)
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No.8831-2 - 2020/05/08 (金) 12:51:23 - おお
> 間ではなく端っこの5'末端(5'UTRやexon1)がsplicingで切り落とされる可能性はありえますでしょうか。
>
5’末端の配列が違うのはおそらく転写開始位置が違うのだろうと思います。またあるmRNAにおいて複数の転写開始点がある場合、上流の転写開始位置から転写が始まり、下流の転写開始位置のあたりをスプライシングで飛ばして、Exon2につながっていたりすることもあるでしょう。
参考にした配列が完全長ではなくって5’末端の配列がないこともありえます。
splicingについて
削除/引用
No.8831-1 - 2020/05/08 (金) 12:31:07 -
うさぎ
いつも質問させていただいております。
splicingについての質問です。
転写後に間のintronやexonを除去して様々なtranscriptを作りますが
間ではなく端っこの5'末端(5'UTRやexon1)がsplicingで切り落とされる可能性はありえますでしょうか。
詳しい方がいらっしゃいましたらお教えいただけますと幸いです。
よろしくお願い致します。
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