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リアルタイムPCRでイントロンが必要な理由 トピック削除
No.878-TOPIC - 2012/08/29 (水) 12:03:41 - 大きな木
リアルタイムPCRのプライマー設計で何故
イントロンを挟む必要があるのでしょうか?
初学者のため,基本的な質問で申し訳ございませんが,
ご教示のほど何卒宜しくお願い申し上げます。
 
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(無題) 削除/引用
No.878-8 - 2012/08/30 (木) 11:10:27 - 大きな木
皆様,暖かいご指導を頂きまして誠に有難うございます。
今後とも何卒ご指導ご鞭撻のほど何卒宜しくお願い申し上げます。

(無題) 削除/引用
No.878-7 - 2012/08/30 (木) 11:03:14 - おお
>回答を覚えるのと違って、新しい疑問が出てきたときにも対応できます。

そうですね。自分で調べることもだいじですね。くわえてぐぐると結構いろいろなレベルの意見が出ますから見分けることも必要でその訓練も日ごろからしていた方がいいかもしれません。これは学術的な記述だけで調べてもそういうことがありますし。

でもその前に、何が起こるのかとかもっとシミレーションしてある程度答えかもしれないと思うものを用意してから確かめるようにしてほしいというのもありますね(そうしたあとに投稿したのかもしれませんが)。

結局なぜかという答えがわかると、そんなにたいしたことでもないだれでも考えれそうなものだったりもしますし。

(無題) 削除/引用
No.878-6 - 2012/08/30 (木) 08:52:38 - ↓
↓それってドラゴン桜に出てたネタですね。
わかります。

(無題) 削除/引用
No.878-5 - 2012/08/29 (水) 22:10:16 - 小言幸兵衛
「魚を与えるのではなく魚の釣り方を教えよ」ですね。

(無題) 削除/引用
No.878-4 - 2012/08/29 (水) 17:59:21 - ~
リアルタイムPCRのプライマー設計で、なぜイントロンを挟む必要があるか疑問に思う。
→リアルタイムPCR イントロン でgoogle検索する
→ヒットした資料
 リアルタイムRT-PCR 実験法
 http://www.takara-bio.co.jp/prt/pdfs/prt1-2.pdf
 を開く
→「ゲノムDNA は、エキソン、イントロン構造を持っているため、これを利用してゲノムDNA 由来の増幅が起こらないようなプライマーを設計することができる。まず、目的遺伝子のゲノム構造を確認し、サイズの大きなイントロンを選び出す。そして、このイントロンを挟む2つのエキソン上に上流プライマー、下流プライマーをそれぞれ設計する。イントロンのサイズが十分に大きければ、ゲノムDNA 由来の増幅が起こらず、イントロンのサイズが小さい場合にも、ゲノム由来のPCR 増幅産物は、mRNA 由来のものよりもサイズが大きくなるため、融解曲線分析で区別ができる。」
 を読む
→ (゚д゚)ウマー

回答を覚えるのと違って、新しい疑問が出てきたときにも対応できます。
英語でも検索できるようになると、なおいいでしょう。

(無題) 削除/引用
No.878-3 - 2012/08/29 (水) 13:12:00 - おお
指摘があるように、ゲノムのコンタミから来るシグナルを避けるためです。しかしながら必要とまではいえません。イントロンレスのものはできないといった矛盾も生じますし、原核生物などではまずイントロンはほとんどすべての遺伝子で見つからないでしょうし。

(無題) 削除/引用
No.878-2 - 2012/08/29 (水) 12:39:11 - 直輝
RNA試料にゲノムDNAが混入していた場合に、real-time PCRの結果が不正確になってしまうのを避けるためです。

リアルタイムPCRでイントロンが必要な理由 削除/引用
No.878-1 - 2012/08/29 (水) 12:03:41 - 大きな木
リアルタイムPCRのプライマー設計で何故
イントロンを挟む必要があるのでしょうか?
初学者のため,基本的な質問で申し訳ございませんが,
ご教示のほど何卒宜しくお願い申し上げます。

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