GEOからダウンロードしたRNAseqデータに関して質問です。GSE...dge.txtファイルをreadMM()でRにimportしたところ遺伝子発現値のmatrixはRに読み込まれますが、dge.txtファイル中で%%以降に記述されている遺伝子名とサンプル名が取り込まれません。どのようにすれば遺伝子名とサンプル名の情報をR中に取り込めるのでしょうか。どなたか詳しい方がいらっしゃればご指導ください。importしたいdge.txtファイルは以下のように記述されています。
%%MatrixMarket matrix coordinate integer general
%%GENES 以降タブ区切りで遺伝子名が記述
:
%%CELL_BARCODES 以降タブ区切りでサンプル名が記述
:
1 444 1のような3つ数字が記述
:
よろしくお願いいたします。 |
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