>細胞株にsiRNAを試したいのですが、どの細胞株で行うべきかわかりません。
この発言からは特定の蛋白が想定されていて細胞株を探しているように聞こえる、
>ウエスタンブロッティングでやみくもに抗体を購入し使用しても細胞株に存在しないDNAであったら意味ない
使える細胞株から高発現していると思われる蛋白を検索するという印象をもつ。
あなたの目的に応じて使いにくい、使いやすいなどあると思いますがどのようなアプローチをするかという点で決まりがあるわけではないし、どうするかは研究者の個性でもありますから答えるというのはちょっとどうかなとも思います。
Cell lineのチョイスがある程度決まっているならその名前とRNseqやマイクロアレー、プロテオミクスなどで文献検索してもいいくらいだと思います。癌関連であれば初期の段階から色々やられているだろうと思いますので。 |
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