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KOとKDの違い トピック削除
No.8657-TOPIC - 2020/02/17 (月) 06:50:22 - かあさん
ノックアウトとノックダウンの違い

最近KOとかKDとか色々な言葉が増えてきており、
私はついていけなくなりつつあります。
５５歳2児の母、いわゆる普通のおばちゃんです。ご容赦ください。

KOとは遺伝子の完全削除、KDとは何割か削除ということでよろしいのでしょうか？

また、人の遺伝子多形の多くは一部をのぞいて完全削除型よりも何割か減少しているタイプの方が多いと思うのですが、これはいわゆるKDに該当するのでしょうか？
　
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No.8657-6 - 2020/02/22 (土) 10:23:07 - たぶん
ノックアウト細胞作るよりノックダウンベクター作る方が早くできるから、実験結果が早くでる。ノックダウンは複数種類の遺伝子について解析しやすい。ノックダウンで細胞に変化が見られなかったとき仮説が間違ってたと決断しきれないことがある。

(無題) 削除/引用
No.8657-5 - 2020/02/17 (月) 11:05:29 - AP
従来の変異、多型による遺伝子機能の喪失や低下を言うなら、amorph,またはnullやhypomorph, complete loss-of-fanction (LOF)やpartial LOFといった、由緒正しい言葉がある。

(無題) 削除/引用
No.8657-4 - 2020/02/17 (月) 11:00:19 - AP
どっちも遺伝子操作の手技のことで、本来、天然の遺伝子多型、遺伝子変異には使いません。

どちらも、ここに書いたように、あんまり由緒正しい生物学用語ではなく、もともとはこの業界のjargonでした。
http://www.kenkyuu2.net/cgi-biotech2012/biotechforum.cgi?mode=view;start=6;Code=8622

KOは遺伝子破壊で完全に機能を失わせること。天然あるいはランダム変異誘導で生じたnull mutation, amorphの意味で使う人も散見されるけれど、本来はgene targettingで標的遺伝子を狙って破壊する手法を指すものだと私は思う。

KDはRNAiでmRNAを切るとか翻訳抑制して、遺伝子機能を抑制する手法に使われ始めた言い方。

(無題) 削除/引用
No.8657-3 - 2020/02/17 (月) 09:42:56 - かあさん
王様

とってもご親切にありがとうございますね。

(無題) 削除/引用
No.8657-2 - 2020/02/17 (月) 07:27:20 - おお
＞KOとは遺伝子の完全削除

だいたいそんな感じで捕らえていいとおもいます。対象の遺伝子がなくなった状態または機能しなくなった状態。もうちょっと具体的に言うなら対象の遺伝子をコードする部分のDNAがなくなったり、機能的になくなったと判断できるようなとき。

＞KDとは何割か削除

描いている事はあたらずとも遠からず。科学的な言い方ではないですが、そんな感じです。科学的には遺伝子は削除されてはいないが、遺伝子の発現を強制的に抑制した状態です。遺伝子があってもそれが発現してないと遺伝子の効果は現れません。なのでKDは遺伝子の効果を抑制しているという事です。

＞人の遺伝子多形の多くは一部をのぞいて完全削除型よりも何割か減少しているタイプの方が多いと思うのですが、これはいわゆるKDに該当するのでしょうか？

多型と一般的にはかかれます。これはKDとちがいます。人に個性があるように同じ遺伝子も人それぞれ個性があります（頻度の程度はおいといて）。その個性とはたとえばある人の特定遺伝子は他の人より機能的にすこし弱いとか、強いとか、機能の一部に若干の違いが見られるとか、そんな感じのことが多いです。

KOとKDの違い 削除/引用
No.8657-1 - 2020/02/17 (月) 06:50:22 - かあさん
ノックアウトとノックダウンの違い

最近KOとかKDとか色々な言葉が増えてきており、
私はついていけなくなりつつあります。
５５歳2児の母、いわゆる普通のおばちゃんです。ご容赦ください。

KOとは遺伝子の完全削除、KDとは何割か削除ということでよろしいのでしょうか？

また、人の遺伝子多形の多くは一部をのぞいて完全削除型よりも何割か減少しているタイプの方が多いと思うのですが、これはいわゆるKDに該当するのでしょうか？
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