Bio Technical フォーラム

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おすすめの解析ソフト トピック削除
No.8604-TOPIC - 2020/01/29 (水) 22:59:37 - 犬飼
はじめまして。
現在、様々な条件下で神経細胞を培養しており、培養後の(1)神経軸索長や(2)側枝の本数や長さといった解析をしたいと考えております。これまでに培養時の細胞密度を振って個々の神経細胞の軸索が重ならない程度でサンプリングできるようにしました。解析は神経軸索をTau染色後に画像取得(jpgまたはtif)に実施します。

ここでご質問内容ですが、視野内にある程度の数の細胞が含まれています。なるべく客観的に評価したいので、画像データを基に上記目的に合致した解析を実施できるソフトさがしております。神経細胞を対象とした解析ソフトだけでもいくつか種類があるため、皆様の経験談等からおすすめの解析ソフトがあればご紹介していただけないでしょうか。ソフトは有償、無償のどちらでも構いません。

どうぞ宜しくお願い致します。
 
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(無題) 削除/引用
No.8604-2 - 2020/01/31 (金) 16:09:44 - tts
神経細胞の軸索の長さや太さをハイコンテントアナリシスの解析ソフトで定量したことがあります。
私が使っていたのは横河電機のCQ1と言う機器で、他にもThermoのCX5でも同様の処理ができたはずです。
ただ、CQ1では専用の拡張子を取っているため、他の機器で撮影した画像を解析させることが出来ず、そのため機器とソフトを両方購入しなければならないので値が張ってしまうのが困ったところです。

後は、手作業で煩雑になりますがImageJで解析するくらいでしょうか、、、

参考になれば幸いです。

おすすめの解析ソフト 削除/引用
No.8604-1 - 2020/01/29 (水) 22:59:37 - 犬飼
はじめまして。
現在、様々な条件下で神経細胞を培養しており、培養後の(1)神経軸索長や(2)側枝の本数や長さといった解析をしたいと考えております。これまでに培養時の細胞密度を振って個々の神経細胞の軸索が重ならない程度でサンプリングできるようにしました。解析は神経軸索をTau染色後に画像取得(jpgまたはtif)に実施します。

ここでご質問内容ですが、視野内にある程度の数の細胞が含まれています。なるべく客観的に評価したいので、画像データを基に上記目的に合致した解析を実施できるソフトさがしております。神経細胞を対象とした解析ソフトだけでもいくつか種類があるため、皆様の経験談等からおすすめの解析ソフトがあればご紹介していただけないでしょうか。ソフトは有償、無償のどちらでも構いません。

どうぞ宜しくお願い致します。

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