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(無題) 削除/引用 No.8588-8 - 2020/02/05 (水) 12:52:11 - Yuma 皆様有難う御座いました。 RecBCD(Exonuclease V)での除去を試してみようと思います。

(無題) 削除/引用 No.8588-7 - 2020/01/28 (火) 02:31:57 - おお 酵素使うのも手だけど、電気泳動で切り出しとかのほうが直接的かなとも思うがどうだろう。それともちょっと大きすぎて面倒か？

(無題) 削除/引用 No.8588-6 - 2020/01/26 (日) 00:09:41 - SYBR master linear DNAだけを除きたいなら、RecBCD(Exonuclease V)使うと良いですよ。

(無題) 削除/引用 No.8588-5 - 2020/01/24 (金) 10:41:48 - AP >cos endは5'突出だからexo IIIなんかでもいけるし 考えてみたら、exo IIIだと一本鎖が残ってしまいますね。S1とかMung beanと併用しないといけない。

(無題) 削除/引用 No.8588-4 - 2020/01/23 (木) 19:11:33 - AP >直鎖状のDNA鎖のみを分解するexonucleaseがあるということでしょうか。 exonucleaseはフリーのDNA末端から分解してくから、末端のない環状DNAは分解されない。 cos endは5'突出だからexo IIIなんかでもいけるし、BAL31 exonucleaseなんか強力そうだ。 ligation kitはいい選択じゃないかな。 でもはっきり言って、なんでも良いと思う。 一応、各製品、差別化されているけど、これ使えばoKだけど別の使ったらnothingなんてことはないので。

(無題) 削除/引用 No.8588-3 - 2020/01/23 (木) 18:00:18 - Yuma AP様： 直鎖状のDNA鎖のみを分解するexonucleaseがあるということでしょうか。 試薬名を教えて頂けましたら幸いです。 またライゲーションについて、TaKaRa DNA Ligation Kit LONGを使うことを考えております。コメント頂けませんでしょうか。

(無題) 削除/引用 No.8588-2 - 2020/01/23 (木) 17:50:48 - AP 環状型を選択的に作ることはできません。 コンカテマー化するのにライゲーションすることがありますが、見事に重合体ばかりできているように見えます。 理屈で言えば、環状化を狙うときは、DNA濃度をうんと薄くして、ライゲーション温度を低くして、エンハンサー的なもの（PEGなど）は入れないで、ってことになりますが、それでもコンカテマーのほうが多くできると思います。 ライゲーションしてから、exonucleaseで環状化していないDNAを分解するとかしたら良いかも

Lambda phage DNAの環状化について 削除/引用 No.8588-1 - 2020/01/23 (木) 17:43:34 - Yuma 遺伝子工学の知識が少ないものです。 閉環状のLambda Phage DNAを調製したいです。 リガーゼを使えばいいのだろうとは思っているのですが、 最適な方法を教えて頂けませんでしょうか。 分子間の反応を抑制し、分子内のみで反応させるには、 希薄溶液から調製するべきかと思うのですが、 どの程度の濃度が良いでしょうか。 多くの情報をいただけますと幸いです。

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