Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

FACS時の細胞のWashについて トピック削除
No.8563-TOPIC - 2020/01/15 (水) 21:25:26 - FACSマン
いつもお世話になっております。

FACSで細胞表面タンパク質の発現解析を行っているものです。

2次抗体をBuffer (0.1% BSA, 1mM EDTA, PBS(-))に溶解し、1時間反応を終えた後、みなさんどのような手順で細胞を回収するのか教えていただきたいのです。

と言いますのも、2次抗体処理後、遠心し上清を取り除いた後、Washを行わずにそのまま再度bufferにて懸濁してFACS解析すると目的のタンパク質発現が確認できますが、しっかりと未反応の2次抗体を除こうという目的で、同様のbufferにてwash, 遠心の作業を一度追加し、再度bufferに懸濁してFACS解析を行いますと、タンパク発現が確認できなくなるという経験があります。

ノンスペの可能性もあるのかもと思いましたが、既知の報告と同様に発現の低いタンパクは低くでますし、明らかに2次抗体処理後にWashすることによって、1次抗体と2次抗体との結合が外れるなどの問題が生じるのではないかと考えています。

同様の経験をされた方はおられますでしょうか?
もしおられましたらコメントいただけますと嬉しいです。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.8563-2 - 2020/01/16 (木) 02:59:56 - コントロール
アイソタイプコントロールを置いていますか?
洗浄しないとバックがかなりたかくなりますが。

二次抗体なし
二次抗体だけ、洗浄なし
二次抗体だけ、洗浄あり

でぜひ比較して欲しいです。

KDが大きい抗体では洗浄でどんどん剥がれていきますね。

FACS時の細胞のWashについて 削除/引用
No.8563-1 - 2020/01/15 (水) 21:25:26 - FACSマン
いつもお世話になっております。

FACSで細胞表面タンパク質の発現解析を行っているものです。

2次抗体をBuffer (0.1% BSA, 1mM EDTA, PBS(-))に溶解し、1時間反応を終えた後、みなさんどのような手順で細胞を回収するのか教えていただきたいのです。

と言いますのも、2次抗体処理後、遠心し上清を取り除いた後、Washを行わずにそのまま再度bufferにて懸濁してFACS解析すると目的のタンパク質発現が確認できますが、しっかりと未反応の2次抗体を除こうという目的で、同様のbufferにてwash, 遠心の作業を一度追加し、再度bufferに懸濁してFACS解析を行いますと、タンパク発現が確認できなくなるという経験があります。

ノンスペの可能性もあるのかもと思いましたが、既知の報告と同様に発現の低いタンパクは低くでますし、明らかに2次抗体処理後にWashすることによって、1次抗体と2次抗体との結合が外れるなどの問題が生じるのではないかと考えています。

同様の経験をされた方はおられますでしょうか?
もしおられましたらコメントいただけますと嬉しいです。

2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。