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(無題) 削除/引用 No.8528-3 - 2019/12/26 (木) 13:36:06 - ちき 実際の解析にそれほど経験がある訳ではありませんが、FWERをコントロールする方法では基準が厳しくなりすぎるために、FDRをコントロールする方法が使われるようになったはずなので、BH法が厳しいというなら、あらゆる多重検定補正は使えないことになると思います。 個人的には、実験で個別に確認することが前提なら、多重検定補正なしのt検定(あるいはmoderated t検定などの改良法)のp値が低いほうから順番に候補とすればいいだけだと思っています。

(無題) 削除/引用 No.8528-2 - 2019/12/26 (木) 03:42:44 - シーバス 追加になりますが、500の遺伝子で解析したら、500全てでp値を計算して、BH法で解析するのか、上位の遺伝子のみを解析するのかでも補正p値がだいぶ異なります。 みなさんどうされていますか？

Benjamini&#8211;Hochberg補正の意義 削除/引用 No.8528-1 - 2019/12/26 (木) 03:09:04 - シーバス 500ほどをターゲットにした網羅的遺伝子解析を行っていて、ある遺伝子で明らかな有意差が見つかりました（p<0.01）。 一定数の遺伝子セットを解析していることを考慮して、Benjamini&#8211;Hochberg補正を加えたのですが、結果は箸にも棒にもかからない非常に高い値が算出されました。 元の数値では明らかな差があるのですが、Benjamini&#8211;Hochberg補正で有意差を出そうと思うと、考えられないほどの大規模解析でもしない限り、有意差は出そうにありません。Benjamini補正に関しては、みなさんどのようにとらえていますか？ 別のアプローチを加えて有意差が正しいことは明らかにしていますが、この話は別として、そもそものこの補正の意義が問われるところかと思いました。 統計解析はあくまで統計解析という議論はわかりきっていますが、解析経験のある方はいらっしゃいますか？

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