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レビュアーからのコメント トピック削除
No.8452-TOPIC - 2019/11/28 (木) 01:32:00 - ともや
レビュアーからのコメントで意味を掴めない箇所があります。

ふローサイトメトリー のデータで、肺のmCherryレポーター陽性の細胞のサイズの違いを右肺と左肺とで比較しました。左の方でFSC-Aの値が大きいことを示しました。そのデータに関してレビュアーから以下のコメントをもらいました。

The cell isolation for flow cytometry could preferably indicate how good your coverage was.

そもそもこれはレビュアーからのcriticismなのかただのコメント（といっても、私の解釈は間違っていると言われてる気もします）で、特に何もアクションや返答をしなくてもよいのか、わかりません...。できればレビュアーの全てに誠実に答えたいのですが、どう解釈して良いのかわかりません。

そもそもカバレージはこの場合どの意味で使われているのでしょうか...？
みなさんはこういう質問か、コメントかわからないようなレビュアーの意見に対してどうアクションを取られますか？
　
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No.8452-7 - 2019/11/28 (木) 10:08:59 - ちき
基本的にはAさんと同じように思いました。ゲートのかけ方などflow cytometryの中の話ではなく、flow cytometryのために採取した細胞が肺の細胞のよいrepresentativeになっているかどうかを聞いているのだと思います。

こうすればもっと良くなるよ、的な好意的なニュアンスを強く感じます。

(無題) 削除/引用
No.8452-6 - 2019/11/28 (木) 08:00:42 - A
左右の肺の比較をする際に、肺のどこの部分の細胞をとってきているのかをちゃんと説明すればより説得力が出る（=ちゃんと説明せよ）と言っているのでは？都合の良い領域の細胞だけをとってきているのではないということを説明せよという意味だと思います。cover はゲートの掛け方ではなく、この実験がちゃんと用件を満たしている（cover）という意味に感じます。基本的に好意的に捉えている中で出てきているコメントに見えます。

(無題) 削除/引用
No.8452-5 - 2019/11/28 (木) 07:50:17 - み
mcherry陽性細胞って肺を構成する細胞のうち何の細胞ですか？
I型、U型肺胞細胞とか色々あるでしょう。
そういった特定の細胞が陽性になるなら、フローに流した細胞集団の内、何パーセントに相当するとか示せたりできるよね。
でも方法論が全く記載されていない外部の人間からは想像でしかなく、何を指摘されているのかわからん。

(無題) 削除/引用
No.8452-4 - 2019/11/28 (木) 02:50:41 - ともや
すいかさん、早速コメントいただきありがとうございます。
やはりカバレージはゲートの掛け方、あるいはきちんと組織をシングルセルに出来ていて、その全てのポピュレーションがFSC、SSCドットプロット内に表示されているか、を聞かれているのでしょうかね。

ひょっとしたらフローサイトメトリーをやられてる方にとってはカバレージはよく使われてるタームだったのかとも思いましたが、そうではなさそうですね...
まずはゲーティングストラテジーを示してみようと思います。
ありがとうございます。

(無題) 削除/引用
No.8452-3 - 2019/11/28 (木) 02:00:05 - すいか
あるいは実際にフローに流した細胞はどんな細胞だったのか、肺の細胞？肺にある血液細胞？その割合、解析に使った細胞の割合とか？

(無題) 削除/引用
No.8452-2 - 2019/11/28 (木) 01:55:10 - すいか
どうでしょうねぇ・・・「ゲートのかけかたによるよね」ってことでしょうか？どういう手順で解析したの？ってことかな？前後のコメントもどんな結果かもわからないからなんとも。（全然見当違いだったらごめんなさい。）返信で素直に聞くしかないかもしれませんね。

レビュアーからのコメント 削除/引用
No.8452-1 - 2019/11/28 (木) 01:32:00 - ともや
レビュアーからのコメントで意味を掴めない箇所があります。

ふローサイトメトリー のデータで、肺のmCherryレポーター陽性の細胞のサイズの違いを右肺と左肺とで比較しました。左の方でFSC-Aの値が大きいことを示しました。そのデータに関してレビュアーから以下のコメントをもらいました。

The cell isolation for flow cytometry could preferably indicate how good your coverage was.

そもそもこれはレビュアーからのcriticismなのかただのコメント（といっても、私の解釈は間違っていると言われてる気もします）で、特に何もアクションや返答をしなくてもよいのか、わかりません...。できればレビュアーの全てに誠実に答えたいのですが、どう解釈して良いのかわかりません。

そもそもカバレージはこの場合どの意味で使われているのでしょうか...？
みなさんはこういう質問か、コメントかわからないようなレビュアーの意見に対してどうアクションを取られますか？
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