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RNA later の病原菌不活化作用について
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No.8375-TOPIC - 2019/11/06 (水) 17:54:01 -
rondo
サルモネラ菌に感染させた動物から、腸管を取り出し、腸管遺伝子の発現量を検討予定です。
取り出した腸管はRNA laterに浸漬予定ですが、この際、腸管に付着しているであろうサルモネラ菌は不活化(サンプルに感染性がない状態)されているものなのでしょうか。
RNAを安定させつつ、病原菌を不活化させる試薬としては、DNA/RNA Shield 等がありましたが、できれば同様の効果がRNA later にあれば使いやすいと思っています。
どなたかご教示いただけると幸いです。
何卒宜しくお願い申し上げます。
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(無題)
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No.8375-5 - 2019/11/07 (木) 13:12:21 -
rondo
moz 様、AP 様
早速にご回答いただきまして、ありがとうございました。
静菌させるにとどまり、不活化とまではいかないようですね。
実験手法を再考したいと思います。
ありがとうございました。
(無題)
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No.8375-4 - 2019/11/06 (水) 18:23:30 - AP
Technical Bulletinにこうあります。
Bacteria
RNAlater is bacteriostatic; although bacteria do not grow in RNAlater, the cells remain intact. E. coli cells stored in RNAlater for 1 month at 2-8C are intact and yield undegraded RNA.
静菌性はあるが、一ヶ月保存しても大腸菌はintactだと。つまり生きてるってことですね。
https://www.sigmaaldrich.com/content/dam/sigma-aldrich/docs/Sigma/Bulletin/1/r0901bul.pdf
(無題)
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No.8375-2 - 2019/11/06 (水) 18:00:46 - moz
RNA laterの組成は、特許文書によると、以下のようです。
25 mM Sodium Citrate, 10 mM EDTA, 70 g ammonium sulfate/100 ml solution, pH 5.2.
高張液ですので、細菌は不活性化するとは思いますが死滅するかは不明です。
RNA later の病原菌不活化作用について
削除/引用
No.8375-1 - 2019/11/06 (水) 17:54:01 -
rondo
サルモネラ菌に感染させた動物から、腸管を取り出し、腸管遺伝子の発現量を検討予定です。
取り出した腸管はRNA laterに浸漬予定ですが、この際、腸管に付着しているであろうサルモネラ菌は不活化(サンプルに感染性がない状態)されているものなのでしょうか。
RNAを安定させつつ、病原菌を不活化させる試薬としては、DNA/RNA Shield 等がありましたが、できれば同様の効果がRNA later にあれば使いやすいと思っています。
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