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サーマルサイクラーの蓋の温度設定について トピック削除
No.8305-TOPIC - 2019/10/08 (火) 09:58:53 - にゃん
サーマルサイクラーの蓋の温度設定について

RNAからcDNAの逆転写反応を行いたく
サーマルサイクラーを用いる予定です。

試薬はSuper Script W Reverse Transcriptaseを用い、
1.と2.の工程を行います。
1.Anneal primer to template RNA
65℃ 5分 →on ice 

2.Incubate reactions
55℃ 10分
80℃ 10分

プロトコルへ記載がなかったのですが、
蓋の温度はそれぞれ何℃くらいに設定するのが
良いでしょうか。
ご教授頂きたく何卒宜しくお願い致します。
 
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(無題) 削除/引用
No.8305-4 - 2019/10/08 (火) 11:37:04 - AP
・それくらいの反応ならヒートリッドは必要でない。それそころかサーマルサイクラーでやる必要もない。ウォーターバスやヒートブロックでやるような反応(もちろんサーマルサイクラーでやってもいいわけだけど)。

・ヒートリッドは反応温が高い時に役立つもの。チューブ内の空気(水蒸気)の温度より管壁や蓋の温度が低くなるような条件の時に起こる凝結を防ぐ(そういう状況になるにはそれなりの温度や時間が必要だろう)。
したがってリッドの温度は反応温度より幾分高ければ良いわけだけど、高すぎるとまずいということもないので(余計な電力を使うとか、、)PCRの時の設定そのままでも構わないでしょう。
リッドの温度が固定で、任意の設定ができない機種もある。

(無題) 削除/引用
No.8305-3 - 2019/10/08 (火) 10:50:48 - asan


普通は、hot lidでやらないとmineral oilとかで蓋してないと蒸発してしまって水蒸気が蓋につくことになると思いますけど?

ま10分程度なら関係ないか。

通常の器械なら97-100Cくらいになると思います。

(無題) 削除/引用
No.8305-2 - 2019/10/08 (火) 10:37:47 - h
うちは蓋の温度設定はなしでやっています

これは元々RTの工程をサイクラーではなくヒートブロックを使っていたころのなごりです

サーマルサイクラーの蓋の温度設定について 削除/引用
No.8305-1 - 2019/10/08 (火) 09:58:53 - にゃん
サーマルサイクラーの蓋の温度設定について

RNAからcDNAの逆転写反応を行いたく
サーマルサイクラーを用いる予定です。

試薬はSuper Script W Reverse Transcriptaseを用い、
1.と2.の工程を行います。
1.Anneal primer to template RNA
65℃ 5分 →on ice 

2.Incubate reactions
55℃ 10分
80℃ 10分

プロトコルへ記載がなかったのですが、
蓋の温度はそれぞれ何℃くらいに設定するのが
良いでしょうか。
ご教授頂きたく何卒宜しくお願い致します。

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