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ある遺伝子リストの中から興味ある遺伝子を見つける方法 トピック削除
No.8181-TOPIC - 2019/08/22 (木) 09:28:39 - みなみ
とても漠然とした質問になってしまいますが、私はある転写因子を研究しています。
ChIPシークエンスを行う前に、ChIPアトラスというサイトを利用して、私の転写因子の標的遺伝子となりうる遺伝子を調べてみました。

すると約500個ほど出てきました。

この中で、私の興味ある表現系である乳がんに関連するものを見つけられたらと考えていますが、一つずつパブメドやグーグルスカラー、OMIMで探すのは効率を考えると難しいです。

この遺伝子リストを元に、”breast cancer”というキーワードと関連の強い遺伝子を取り出す方法はありませんでしょうか?私はあまりこういったバイオインフォマティクスに明るくなく、周りにも聞けませんのでここで質問させていただきました。

とても漠然とした質問で申し訳ないのですが、よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.8181-2 - 2019/08/22 (木) 10:29:03 - おお
https://david.ncifcrf.gov/

確かここで出来たとおもうけど

ある遺伝子リストの中から興味ある遺伝子を見つける方法 削除/引用
No.8181-1 - 2019/08/22 (木) 09:28:39 - みなみ
とても漠然とした質問になってしまいますが、私はある転写因子を研究しています。
ChIPシークエンスを行う前に、ChIPアトラスというサイトを利用して、私の転写因子の標的遺伝子となりうる遺伝子を調べてみました。

すると約500個ほど出てきました。

この中で、私の興味ある表現系である乳がんに関連するものを見つけられたらと考えていますが、一つずつパブメドやグーグルスカラー、OMIMで探すのは効率を考えると難しいです。

この遺伝子リストを元に、”breast cancer”というキーワードと関連の強い遺伝子を取り出す方法はありませんでしょうか?私はあまりこういったバイオインフォマティクスに明るくなく、周りにも聞けませんのでここで質問させていただきました。

とても漠然とした質問で申し訳ないのですが、よろしくお願いします。

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