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PAXgene採血管からのRNAにキアゲンキットを使わない方法 トピック削除
No.8137-TOPIC - 2019/08/07 (水) 04:21:18 - MASU
急遽、臨床からのサンプルからRNA抽出することになりました。
PAXgene採血管に採血された血液はすでにこの特殊な採血管内で壊れています。
そのためRNAは速やかに安定化されています。

約5mlほどのサンプルなのですが、ここからRNAを抽出するキットを持っておりません。
キアゲンのPAXgene採血管からのRNA抽出に専用のキットが売られていますが、買うと50サンプル分もあり、やや気が引けます。

どうにかこのサンプルからRNAをキットを使わずに抽出したいのですが、どういった方法がありますでしょうか?

私はルーチンに培養細胞やマウス組織からトリゾールを使い、イソプロ沈、エタ沈でRNAを回収しています。
ご教示いただけませんでしょうか、よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.8137-4 - 2019/08/07 (水) 15:17:10 - SYBR master
PAXgene RNA採血管に入っている、RNA安定化剤が何か判らないのに、他の方法で取れるかどうか、やってみないと判らないのでは無いでしょうか?

RNA抽出のprotocol読むと、PAXgene RNA採血管では採血と同時に溶血だけで無く他の細胞も溶かしているのだとしたら、RNA-free water加えて、遠心後のペレット(RNAおよびDNA)がどのようなメカニズムで沈殿できているか判らないので、指定のキット以外で取れるかどうか良く解らないです。採血と同時に起きて言うrのが溶血のみで、ペレットが細胞なら、一般的なキットでも取れると思います。が、Buffer BM2とBM3の廃液を漂白剤と一緒にしないでくださいとの文言もきになりますね。このキットには何か特殊な物、入っていそうです。

臨床サンプルと言うことは、下手すると再度入手できませんよね?自分も以前、臨床サンプルで一度失敗したことがあるので気になります。取れなかったとき、指定されている方法では無いなんて言い訳にならないので、自分なら指定のキットを使います。

(無題) 削除/引用
No.8137-3 - 2019/08/07 (水) 13:38:27 - bluehornet
TRIzol LSはどうでしょうか?
全血ならRNase Free Waterで2倍希釈すれば使えるようです。

Takaraから同等品のRNAiso Bloodも出ていますが、こちらは2倍希釈なしでも使えるようです。
評価用サンプルももらえたと思います。

(無題) 削除/引用
No.8137-2 - 2019/08/07 (水) 05:53:33 - おお
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/jmv.1890470208

昔はキットがなかったですし、その頃はCatrimox-14を使っていたようです。それでRNAを沈殿してTRIZOLとかでリカバーしたらいいかな。ただいきなりTRIZOLでリカバリーできるか。。。

PAXgene採血管からのRNAにキアゲンキットを使わない方法 削除/引用
No.8137-1 - 2019/08/07 (水) 04:21:18 - MASU
急遽、臨床からのサンプルからRNA抽出することになりました。
PAXgene採血管に採血された血液はすでにこの特殊な採血管内で壊れています。
そのためRNAは速やかに安定化されています。

約5mlほどのサンプルなのですが、ここからRNAを抽出するキットを持っておりません。
キアゲンのPAXgene採血管からのRNA抽出に専用のキットが売られていますが、買うと50サンプル分もあり、やや気が引けます。

どうにかこのサンプルからRNAをキットを使わずに抽出したいのですが、どういった方法がありますでしょうか?

私はルーチンに培養細胞やマウス組織からトリゾールを使い、イソプロ沈、エタ沈でRNAを回収しています。
ご教示いただけませんでしょうか、よろしくお願いします。

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