いつもお世話になっております。
RNA-seqの処理でまたお知恵をお貸しいただきたく投稿させて頂きました。
RNA-seqのpaire-endのデータを処理しているところです
マッピング前の処理として、低クオリティの塩基の除去やアダプター除去にはTrimmomaticを使ってます
ただ、TrimmomaticにはpolyA tailの除去機能はないため実施しておりません。
そこでご相談なのですが、
マッピング前の処理としてpoly A tailの除去は必要でしょうか?
Trimmomaticにないということは実施しなくて良いのかなとも思ってます。
ご意見いただければ幸いです。 |
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