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プラスミドの耐性遺伝子 カナマイシンとアンピシリン トピック削除
No.8087-TOPIC - 2019/07/18 (木) 22:10:25 - ぷらすみどん
お世話になります。

興味本位なのですがもしよろしければ教えてください。

プラスミドの薬剤耐性遺伝子は「アンピシリン」か「カナマイシン」が主流だと思いますが、自分の研究室のリストを見直すと9割がアンピシリンでした。

こちらで組み替えたものもありますが、多くはAddgeneなどで供与して頂いたものです。

これはうちの研究室だけの偶然でしょうか。


個人的にはカナマイシンの方がサテライトコロニーが抑えられるのでメリットが大きいように感じますが、世の中的にもアンピシリンが主流なのでしょうか。


今はin fusionクローニングを使えば耐性遺伝子をアンピシリンからカナマイシンに組み替えることも簡単にできると思います。

アンピシリンのプラスミドで収量が落ちる原因は、培養中のプラスミドの脱落(大腸菌分裂の際に、プラスミドをもらえなかった大腸菌が出てしまう)が原因の一つだと思います。

もしそうなら、選択マーカーをカナマイシンに載せ替えることで収量アップも期待できるのではと思いました。

もし宜しければアドバイスいただけましたら幸いです。

よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.8087-4 - 2019/07/28 (日) 14:42:46 - ぷらすみどん
皆さま

ありがとうございます。
勉強になりました。

(無題) 削除/引用
No.8087-3 - 2019/07/19 (金) 00:19:09 - おお
研究分野によるでしょうけど、プラスミドを作ったり精製するぶんにはAmpでそんなに変なことが起こるでもなく、何ら問題がないと感じます。

Ampのプラスミドがおおいのは多分pUCやpBluescriptなどにいろいろなものをクローニング(プロモーターとかそういうものを含めて)したりしてそれをベースに作っているものが多いからだと思います。

まあ哺乳動物の細胞などを扱っている一人として感覚ですが、Microbiologyなど他の分野では違うかもしれません。またラボで作ったものがたまたま他の抗生物質耐性マーカーのプラスミドで、実験上の都合などでそれをベースに組み換えを行っていればampでないプラスミドがおおいラボもあるかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.8087-2 - 2019/07/18 (木) 23:24:46 - 独り言
個人的にはアンピシリンのほうが好きです。

ヒートショック後、1分でプレートに撒いて帰れるので。
カナマイシンで毎回そこに1時間ぐらい時間が取れるのは、今更面倒に感じます。

プラスミドの耐性遺伝子 カナマイシンとアンピシリン 削除/引用
No.8087-1 - 2019/07/18 (木) 22:10:25 - ぷらすみどん
お世話になります。

興味本位なのですがもしよろしければ教えてください。

プラスミドの薬剤耐性遺伝子は「アンピシリン」か「カナマイシン」が主流だと思いますが、自分の研究室のリストを見直すと9割がアンピシリンでした。

こちらで組み替えたものもありますが、多くはAddgeneなどで供与して頂いたものです。

これはうちの研究室だけの偶然でしょうか。


個人的にはカナマイシンの方がサテライトコロニーが抑えられるのでメリットが大きいように感じますが、世の中的にもアンピシリンが主流なのでしょうか。


今はin fusionクローニングを使えば耐性遺伝子をアンピシリンからカナマイシンに組み替えることも簡単にできると思います。

アンピシリンのプラスミドで収量が落ちる原因は、培養中のプラスミドの脱落(大腸菌分裂の際に、プラスミドをもらえなかった大腸菌が出てしまう)が原因の一つだと思います。

もしそうなら、選択マーカーをカナマイシンに載せ替えることで収量アップも期待できるのではと思いました。

もし宜しければアドバイスいただけましたら幸いです。

よろしくお願いします。

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