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フォスファターゼの基質アミノ酸配列表記 トピック削除
No.8053-TOPIC - 2019/07/05 (金) 03:25:17 - jo
お世話になります。
あるフォスファターゼの基質の候補を検索するため、以下のアミノ酸配列をphosphosite plusというサイトで解析したという論文があります。
[STEADNR][NPDHLRTY][INSEPGV]pY[VADIEFGSY][DTEGIKNQRS][LFPSTANR]

この配列についているカッコの意味がよくわかりません。
また、上記サイトでの解析方法をご存知の方がいらっしゃいましたらよろしくお願いいたします。
　
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(無題) 削除/引用
No.8053-7 - 2019/07/06 (土) 10:22:29 - おお
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/html/PHIsyntax.html

これと一緒かな

ありがとうございます。 削除/引用
No.8053-6 - 2019/07/05 (金) 11:12:16 - jo
qq様
わかりやすいご説明ありがとうございます!
非常に助かりました。
今後ともよろしくお願い申し上げます。

(無題) 削除/引用
No.8053-5 - 2019/07/05 (金) 09:49:32 - mon
qqさんが正しいです。ご指摘ありがとうございます。
混乱を防ぐため、私の書き込みを削除します。

(無題) 削除/引用
No.8053-4 - 2019/07/05 (金) 08:48:23 - qq
＞[STEADNR][NPDHLRTY][INSEPGV]pY[VADIEFGSY][DTEGIKNQRS][LFPSTANR]
＞この配列についているカッコの意味がよくわかりません。
computerの正規表現になっていると思います。
カッコの中のアミノ酸いずれか一つということ。
例えば、
SNIpYVDL
RYVpYYSR
だったりする。

フォスファターゼの基質アミノ酸配列表記 削除/引用
No.8053-1 - 2019/07/05 (金) 03:25:17 - jo
お世話になります。
あるフォスファターゼの基質の候補を検索するため、以下のアミノ酸配列をphosphosite plusというサイトで解析したという論文があります。
[STEADNR][NPDHLRTY][INSEPGV]pY[VADIEFGSY][DTEGIKNQRS][LFPSTANR]

この配列についているカッコの意味がよくわかりません。
また、上記サイトでの解析方法をご存知の方がいらっしゃいましたらよろしくお願いいたします。
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