Bio Technical フォーラム

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ソニケーションによるDNAの変性 トピック削除
No.8005-TOPIC - 2019/06/20 (木) 10:14:49 - Palms
　ChIPなどの実験で、DNAをランダムに切断するのにソニケーションをすることがあると思います。このときに、２本鎖DNAの乖離（変性）もランダムに一定確率で起きているのでしょうか。

　今回、ChIPではないある実験でDNAをだいたい３００bpくらいにしたいのですが、１本鎖DNAが生じてしまうと困るのです。

　もしご存知の方がおられましたら、ご教授いただけますでしょうか。
　
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(無題) 削除/引用
No.8005-2 - 2019/06/20 (木) 10:59:03 - AP
ふつうは「無い」と思って使っているか「多少あっても問題ない」かでしょう。本当にゼロかどうかは誰も保証できない。自分で実験的に検証するか、手法を検討するしかないのでは。断片化する方法も一本鎖を除去する方法もいろいろあるはずです。

ソニケーションによるDNAの変性 削除/引用
No.8005-1 - 2019/06/20 (木) 10:14:49 - Palms
　ChIPなどの実験で、DNAをランダムに切断するのにソニケーションをすることがあると思います。このときに、２本鎖DNAの乖離（変性）もランダムに一定確率で起きているのでしょうか。

　今回、ChIPではないある実験でDNAをだいたい３００bpくらいにしたいのですが、１本鎖DNAが生じてしまうと困るのです。

　もしご存知の方がおられましたら、ご教授いただけますでしょうか。
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