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統計解析について(3-way ANOVA) トピック削除
No.7787-TOPIC - 2019/03/24 (日) 16:35:00 - FN
無料統計解析ソフトのEZRを使って以下の実験で3-way ANOVAを行ってみましたが、1つの要因だけ0と返って来てしまい、上手くいきません。

Wild typeと遺伝子AおよびB欠損マウスを用いて電気ショック前後の箱内におけるfreezing 時間を、電気ショック前のfreezing 時間の平均値、電気ショック3時間後のfreezing 時間の平均値、電気ショック24時間後のfreezing 時間の平均値を1つのグラフにして統計解析を行おうと考えています。この場合は、遺伝子×電気ショックの有無×時間の3つの要因があると考え、標題の通りに3-way ANOVA で解析してみました。しかし、電気ショック要因の値が0と表示されてしまい、表示されるのは遺伝子、時間、遺伝子×時間しか表示されません。例数はそれぞれ5〜7例ほどです。

なぜこのように遺伝子×電気ショックの有無×時間について計算結果が0と表示されてしまうのかが分からずに困っています。

どなたかアドバイスを頂けると大変助かります。
宜しくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.7787-9 - 2019/03/25 (月) 19:31:11 - FN
ふみさん

ご指摘ありがとうございます。その通りです。
当初の目的を異なる実験でやり直そうと考えております。

また、分からないことがありましたら宜しくお願い致します。
ありがとうございました。

群の数は足りてますか? 削除/引用
No.7787-8 - 2019/03/25 (月) 16:29:13 - ふみ
遺伝子について、変異無し、A欠損、B欠損の3水準
時間について、事前、3時間後、24時間後の3水準
電気ショックについて、無し、有りの2水準
これら掛け合わせて3x3x2=18群のfreezing時間データがあると3-way ANOVAができると思います。
遺伝子要因について変異無し、AB欠損の2水準ならば、2x3x2=12群です。
どの群かが存在しないのではないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.7787-7 - 2019/03/25 (月) 12:42:44 - FN
おおさん、qqさん、Rさん、アドバイス、ありがとうございました。

Rさんの仰る通り、経時変化のデータなので反復二元配置分散分析も考えましたが、電気ショックのある時間と無い時間が混在するめ、やはりqqさんのご指摘通りに3要因としないのが良いと思いました。私の実験プロトコールミスだと反省しました。私には実験計画のセンスも知識も無いのかと落ち込みましたが・・・。

今回は、3時間後と24時間後のfreezingデータでグラフを作り、当初の目的だった電気ショック前のfreezing データ(運動量に変化が無いことを示したかった)は今回取得したデータを取り扱わずに、別の実験で遺伝子欠損により運動量が低下もしくは促進したわけではないという結果を行って改めてグラフにして示そうと思います。

色々とありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.7787-6 - 2019/03/25 (月) 11:28:21 - R
反復測定2元配置分散分析ではだめなのかな?

(無題) 削除/引用
No.7787-5 - 2019/03/25 (月) 10:40:19 - FN
qqさん

御返事ありがとうございます。また貴重なご指摘ありがとうございます。

>>電気ショックなしの場合も3時間後と24時間後があるのかね?
>>要因3つだとすると必要だろうとおもうけど、どうなんだろう?

電気ショック無しの場合は、3時間後と24時間後のデータはありません。電気ショック前後という意味で考えておりました。qqさんに指摘されて、何となくこれがポイントの様な気がして参りました。ありがとうございます。qqさんのご指摘通り、要因を3つとする場合には、これらの値が必要かと思います。そうすると、私が行った実験(グラフ)の要因はいくつと考えて統計処理するのが良いのでしょうか??

>>このままだとすると、電気ショック後の時間(−1,3,24時間)のひとつの要因になるのではないかな?

遺伝子欠損タイプの影響も時間経過(3時間後と24時間後)の影響も要因として考えていたのですが、これは要因にはなり得ないということでしょうか?3時間後と24時間後に及ぼす遺伝子欠損の効果が異なるので要因になると思い込んでいたのですが、勉強不足でした。

EZRの使い方だけでなく、相応しい統計解析法についてのご指摘、アドバイスを頂けると大変助かります。

もう少しお付き合い下されば幸いです。

(無題) 削除/引用
No.7787-4 - 2019/03/25 (月) 10:13:07 - qq
電気ショックなしの場合も3時間後と24時間後があるのかね?
要因3つだとすると必要だろうとおもうけど、どうなんだろう?

>電気ショック前のfreezing 時間の平均値、電気ショック3時間後のfreezing 時間の平均値、電気ショック24時間後のfreezing 時間の平均値を1つのグラフにして統計解析を行おうと考えています。
このままだとすると、電気ショック後の時間(−1,3,24時間)のひとつの要因になるのではないかな?

(無題) 削除/引用
No.7787-3 - 2019/03/25 (月) 07:49:14 - FN
おおさん

トピ文を読んで下さりありがとうございます。

電気ショック前後とする要因が0となるのは、小さすぎるからでは無いようです。結果は、自由度が0と記載されている以外は空白のままとなってしまいます。試に2要因だけで2-way ANOVAで検定しようとしても同じように電気ショック前後要因だけが0と表示されてしまいます。

何かオプション機能が必要なのか、それともエクセルで作成した表が悪いのかなども調べてみましたが、2-way ANOVAでも0となるので3-way ANOVAだけが上手く行かないわけでも無さそうですし、他の2要因であれば検定できますので、エクセルでの表作成が問題なわけでも無さそうです。

私は今回の検定のために初めてEZRをダウンロードしましたので、使い方にも慣れていないためかと思います。周りに聞ける人もいないのとこの掲示板ではかつてEZRが話題になっており、詳しい方が多くいるので聞いてみました。

何かアドバイスを頂けると大変助かります。
どうかよろしくお願いします。

(無題) 削除/引用
No.7787-2 - 2019/03/25 (月) 01:35:03 - おお
要因の値が0といいますが具体的に何の値ですか?F値とか、、、

非常に小さいために表示している小数点範囲では0という可能性がないですか?

統計解析について(3-way ANOVA) 削除/引用
No.7787-1 - 2019/03/24 (日) 16:35:00 - FN
無料統計解析ソフトのEZRを使って以下の実験で3-way ANOVAを行ってみましたが、1つの要因だけ0と返って来てしまい、上手くいきません。

Wild typeと遺伝子AおよびB欠損マウスを用いて電気ショック前後の箱内におけるfreezing 時間を、電気ショック前のfreezing 時間の平均値、電気ショック3時間後のfreezing 時間の平均値、電気ショック24時間後のfreezing 時間の平均値を1つのグラフにして統計解析を行おうと考えています。この場合は、遺伝子×電気ショックの有無×時間の3つの要因があると考え、標題の通りに3-way ANOVA で解析してみました。しかし、電気ショック要因の値が0と表示されてしまい、表示されるのは遺伝子、時間、遺伝子×時間しか表示されません。例数はそれぞれ5〜7例ほどです。

なぜこのように遺伝子×電気ショックの有無×時間について計算結果が0と表示されてしまうのかが分からずに困っています。

どなたかアドバイスを頂けると大変助かります。
宜しくお願いします。

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