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(無題) 削除/引用 No.7688-4 - 2019/02/15 (金) 05:24:03 - おお https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome BlastPで生物種を指定して検索するか、必要ならPHI-BLAST でドメインの特徴的な配列で絞り込めばどうかな。 Informaticsには詳しくないのでもっといい方法があるかもしれないけど。

(無題) 削除/引用 No.7688-3 - 2019/02/14 (木) 15:56:46 - Pワンぬ ＞おお　さん 情報不足でした、パラログ間でのドメイン比較を行いたいと思っています。 1つの植物種内でです。

(無題) 削除/引用 No.7688-2 - 2019/02/14 (木) 15:19:38 - おお https://useast.ensembl.org/index.html オーソログならこちらからリストを見れますが、、、生物間での比較をしたいのか、パラログなどから解析したいのか、、、

特定ドメインをもつタンパク質配列リストの取得 削除/引用 No.7688-1 - 2019/02/14 (木) 14:51:10 - Pワンぬ 特定ドメインの配列を比較してアミノ酸の分子系統樹を作ろうと考えています。 タンパク質のリストはEMBL-EBIのDBから取得しようと考えているのですが検索方法が分からないので教えてほしいです。過去同じような操作を行った方がいればお願いします。

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